Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 DDAH1-206ENST00000633113 703 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 FRG1DP-201ENST00000635586 771 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 EIF3E-206ENST00000519030 1324 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 ZNF679-202ENST00000421025 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 AC011447.7-201ENST00000624228 1590 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 AC112255.1-201ENST00000624070 2493 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 OFD1P8Y-201ENST00000449148 1433 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 RBM41-201ENST00000372479 1662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 CLEC1A-204ENST00000457018 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 MTHFD2P5-201ENST00000320415 844 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 GSTA1-201ENST00000334575 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 DNAJC12-202ENST00000339758 1064 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 RN7SKP28-201ENST00000364770 305 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 G6PC2-202ENST00000375363 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 CDKL4-202ENST00000395035 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 AC096533.1-201ENST00000411645 353 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 AL596448.1-201ENST00000415024 392 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 AL121904.1-202ENST00000416638 656 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 OXSM-202ENST00000420173 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 RPL34P3-201ENST00000421454 338 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 IPPKP1-201ENST00000422501 768 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 TCEAL3-AS1-201ENST00000424887 361 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 IL23R-203ENST00000425614 1295 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 OR5K2-201ENST00000427338 1060 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 LINC00348-201ENST00000428761 948 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 Z93403.1-202ENST00000440002 713 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 AL136988.2-201ENST00000440729 861 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 LINC01911-201ENST00000450667 806 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 DAP3-209ENST00000465375 729 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
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CLIP4Q8N3C7 AC124067.3-201ENST00000522643 847 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
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CLIP4Q8N3C7 LINC02301-201ENST00000553760 773 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 USP3-AS1-202ENST00000559357 455 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
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CLIP4Q8N3C7 RBM22P12-201ENST00000567098 1255 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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CLIP4Q8N3C7 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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CLIP4Q8N3C7 AL512427.1-201ENST00000618593 349 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 LINC01837-206ENST00000636649 1056 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 METTL8-218ENST00000638989 876 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 METTL8-219ENST00000640734 726 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 CYP3A43-203ENST00000342499 1396 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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