Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 TCF12-213ENST00000559703 1544 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC0.88□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 N4BP2-201ENST00000261435 9744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 USP37-201ENST00000258399 8032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC0.88□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 MTRNR2L6-201ENST00000604952 1447 ntAPPRIS P1 BASIC0.88□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 WDR35-201ENST00000281405 6918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF148-201ENST00000360647 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 MID1-202ENST00000380779 6044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 AGO1-201ENST00000373204 13708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.88□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 RFX4-203ENST00000392842 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 DDX18P5-201ENST00000534547 1306 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.88□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC0.88□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 AC093311.1-201ENST00000506586 2021 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 LRP2-201ENST00000263816 15808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 PLCB4-202ENST00000378473 5619 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 RBPJ-202ENST00000342320 5761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 FOXP2-201ENST00000350908 2638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF733P-202ENST00000444809 1573 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 ZC3H12C-202ENST00000453089 9542 ntTSL 2 BASIC0.87□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 BRCA1-210ENST00000471181 5936 ntTSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC0.87□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 PLCE1-203ENST00000371385 6500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 NLGN1-202ENST00000401917 1827 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 ZEB2-244ENST00000638007 9140 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 PTK2-201ENST00000340930 4414 ntTSL 2 BASIC0.87□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC0.87□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 SLC25A17-202ENST00000402844 2405 ntTSL 2 BASIC0.87□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 HIPK1-204ENST00000369555 3966 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 PRDM2-202ENST00000311066 7437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC0.87□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 SORCS1-210ENST00000622431 6701 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 ARHGAP42P1-201ENST00000507474 1976 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 CNOT1-202ENST00000441024 4999 ntTSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 RFTN2-201ENST00000295049 5827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 ARCN1-202ENST00000359415 4038 ntTSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 PDE4D-228ENST00000636120 6659 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 GTSF1-209ENST00000552397 1621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.87□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF610-208ENST00000613461 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 UNC79-203ENST00000553484 9100 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF585B-205ENST00000532828 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.87□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 KCNH7-205ENST00000621889 1893 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 ZC3H11A-202ENST00000367210 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 PSMA3-201ENST00000216455 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 DEFB129-201ENST00000246105 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 SPATA9-201ENST00000274432 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 AL442071.1-201ENST00000289890 558 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 OR8I2-201ENST00000302124 1010 ntAPPRIS P1 BASIC0.87□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 CAPZA3-201ENST00000317658 1087 ntAPPRIS P1 BASIC0.87□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 HIST1H1T-201ENST00000338379 718 ntAPPRIS P1 BASIC0.87□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 CCL20-201ENST00000358813 800 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 RPL12P1-201ENST00000374520 498 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 DEFB121-202ENST00000376314 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 AMELX-202ENST00000380712 835 ntTSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 AMELX-203ENST00000380714 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC0.87□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.5 ms