Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 AC062004.1-201ENST00000518706 686 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NDUFA9Q16795 AC022196.1-202ENST00000559570 462 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NDUFA9Q16795 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NDUFA9Q16795 AC131274.1-201ENST00000582507 254 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
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NDUFA9Q16795 SNRPFP2-201ENST00000440710 251 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
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