Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 TRDN-205ENST00000546248 1179 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 AC092683.2-203ENST00000618807 788 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 AC243960.7-201ENST00000623532 707 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 OR10K1-203ENST00000641432 3775 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 AGO1-201ENST00000373204 13708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 MRPL50P1-201ENST00000431951 384 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 AC069542.2-201ENST00000624816 216 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 LARP1BP1-201ENST00000506036 1359 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 TMEM133-201ENST00000303130 1953 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 ICE2P1-201ENST00000512800 1849 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 LSAMP-205ENST00000490035 9446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 CLEC4E-202ENST00000446457 701 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 BX842559.2-201ENST00000451418 605 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 snoU13.29-201ENST00000459370 104 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 AL035454.1-201ENST00000470758 433 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 TM6SF1-207ENST00000565774 1020 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 SLC14A2-AS1-203ENST00000592286 528 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 AC096553.1-201ENST00000605169 829 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 CTNND1-213ENST00000526357 5994 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 NDUFA9-201ENST00000266544 8363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 FRMD3-207ENST00000621208 5064 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 KIAA0100-203ENST00000544884 6856 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 AC016074.1-201ENST00000518339 636 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 TRIM2-201ENST00000338700 6735 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 CACNA1D-211ENST00000636570 6441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 AL929472.2-201ENST00000419993 481 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 PGAP1-201ENST00000354764 11114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 AC099654.3-201ENST00000447087 1546 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 CEP63-202ENST00000337090 5632 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 MRPS21P3-201ENST00000436696 262 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 AL731574.1-201ENST00000447757 456 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 AJ239318.1-201ENST00000624445 607 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 PTPRZ1-202ENST00000449182 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 MED13L-201ENST00000281928 14234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 LIPG-201ENST00000261292 10441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 CHRM3-201ENST00000255380 8780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 CCL7-203ENST00000394630 687 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 REV3L-IT1-201ENST00000411895 382 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 ABCF2P2-201ENST00000450549 296 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 AP001972.1-201ENST00000529215 506 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 AP000462.1-201ENST00000535704 818 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 SPATA31D5P-201ENST00000376459 4784 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 DNAJC15-201ENST00000379221 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 LINC01814-202ENST00000454224 8839 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 AL929601.4-201ENST00000613011 1341 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 AC092651.1-201ENST00000426110 312 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
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