Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 RNU6-84P-201ENST00000607737 102 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 AC090527.3-201ENST00000619041 548 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 ICE2P1-201ENST00000512800 1849 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 OR51C1P-202ENST00000641159 1444 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 GYPA-212ENST00000616983 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 GTDC1-203ENST00000392867 2408 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 IQCM-206ENST00000636793 1900 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 FAM26D-201ENST00000368596 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 CCDC169-202ENST00000239860 716 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 CLEC7A-203ENST00000310002 425 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 AC008549.2-201ENST00000333482 706 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 IGKV5-2-201ENST00000390244 408 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 FLJ27354-201ENST00000415584 788 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 AC087380.1-202ENST00000415970 1163 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 AL031428.1-201ENST00000427154 666 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 ZDHHC20P1-204ENST00000435787 423 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 LINC02013-201ENST00000438156 526 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 LINC01789-201ENST00000443123 860 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 EEF1B2P5-201ENST00000444820 548 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 FAR2P1-206ENST00000449736 709 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 AC005532.2-201ENST00000467154 373 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 APOPT1-204ENST00000473127 739 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 EEF1A1P25-201ENST00000495704 1267 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 LINC02465-204ENST00000514892 481 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 RNU6-943P-201ENST00000516960 98 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 AC021393.1-201ENST00000531077 433 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 AC007922.3-201ENST00000581648 543 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 Z98949.1-202ENST00000600211 1282 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 OR7M1P-201ENST00000608946 533 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 Metazoa_SRP.170-201ENST00000616060 254 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 AL355306.2-205ENST00000635395 1646 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 OR2L13-202ENST00000641714 1948 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 EEF1A1P42-201ENST00000613436 1331 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 PIGN-217ENST00000591238 1622 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 TMBIM4-201ENST00000286424 989 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 IL6STP1-201ENST00000346911 1020 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 AL356968.2-201ENST00000412769 1257 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 ICA1L-206ENST00000418208 602 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 QRSL1P2-201ENST00000418582 964 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 AL358176.3-201ENST00000420757 454 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 NPM1P22-201ENST00000427761 952 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 NFYAP1-201ENST00000431953 972 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 FSIP2-AS1-202ENST00000436557 689 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 TXNP5-201ENST00000441043 315 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 MTCO3P17-201ENST00000443775 513 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 Z80107.2-201ENST00000445127 392 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 DARS-AS1-206ENST00000446492 488 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 AURKAPS1-201ENST00000451805 1212 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 CLEC2A-202ENST00000455827 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 TRBV8-1-201ENST00000481590 279 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 SETSIP-201ENST00000485873 879 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 PGAM1P13-201ENST00000507497 754 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 THAP6-212ENST00000508105 1103 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 LINC01088-205ENST00000509088 756 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 AC002456.2-201ENST00000509356 380 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 MTCO3P42-201ENST00000509488 518 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 AC021146.3-201ENST00000511911 260 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 MTCO3P39-201ENST00000514812 518 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 OR10D4P-201ENST00000525892 951 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 AC134349.2-201ENST00000535136 910 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 AC091231.1-201ENST00000558443 391 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 AC005692.2-201ENST00000566521 596 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 AC093484.5-201ENST00000585048 304 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 AC004448.4-204ENST00000585389 743 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 AP001542.1-201ENST00000591314 200 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 AC009163.6-201ENST00000612367 342 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 LAMTOR5-AS1-233ENST00000625451 470 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.1 ms