Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 DEFB106B-201ENST00000335479 316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 UQCRFS1P3-201ENST00000407697 385 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 RPS3AP25-201ENST00000411660 793 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 OR13Z1P-201ENST00000416141 834 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 AC093084.1-201ENST00000424233 687 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 AL031428.1-201ENST00000427154 666 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 AL807757.1-201ENST00000437846 424 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 AC079117.1-201ENST00000445178 1000 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 MTND2P30-201ENST00000456663 382 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 AC091917.1-201ENST00000506330 566 ntTSL 4 BASIC6.88□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 AC027338.1-201ENST00000514840 825 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 AC073023.1-201ENST00000522896 773 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 AC106785.3-201ENST00000564064 847 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC6.88□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 MIR4301-201ENST00000577203 66 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 MIR7515HG-226ENST00000588330 1055 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 AL158050.2-201ENST00000605336 568 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 MLECP1-201ENST00000615893 709 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 AL138955.1-201ENST00000622881 1040 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 AP003499.2-201ENST00000624100 483 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 ANKRD26P1-204ENST00000571006 4741 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 GSTCD-202ENST00000394728 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 CSDE1-203ENST00000358528 4076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 ZCCHC6-206ENST00000375963 5379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 UBR4-204ENST00000375254 15906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 OR11H6-201ENST00000315519 993 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 HMGB3P7-201ENST00000400214 611 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 AL159990.1-201ENST00000415119 337 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.87□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 AL034345.2-202ENST00000416948 830 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 BTF3P9-201ENST00000418784 283 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 CENPIP1-201ENST00000425713 902 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 MTND2P21-201ENST00000436242 1042 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 AC073143.1-201ENST00000436316 395 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 AL159990.2-201ENST00000436491 337 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 AC122718.1-201ENST00000439448 744 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 TPTE2P3-201ENST00000441562 1189 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 AL137845.2-201ENST00000444292 988 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 AC026320.1-202ENST00000444729 672 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 IGBP1P3-201ENST00000447449 1000 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 MTATP6P14-201ENST00000455189 673 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 FAM133DP-201ENST00000464802 691 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 AC083829.1-201ENST00000503756 657 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 AC115622.1-201ENST00000509628 587 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 LINC00500-201ENST00000515860 539 ntTSL 4 BASIC6.87□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 AC104350.1-201ENST00000518750 877 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 OR10D4P-201ENST00000525892 951 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 AP001318.3-202ENST00000528876 509 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 LINC01495-201ENST00000532380 421 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 AC009396.1-201ENST00000553628 1079 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 ZFAND6-204ENST00000558087 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 CD24P2-201ENST00000565486 219 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 AC005154.1-213ENST00000578572 445 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 AP005230.1-203ENST00000582086 887 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 AL135786.2-201ENST00000608422 615 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 AC019131.2-201ENST00000609071 870 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 AC005962.2-201ENST00000611427 652 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 UGP2-232ENST00000640075 567 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 PDE4D-226ENST00000546160 7690 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 AC034229.2-201ENST00000566945 2508 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 NF1-202ENST00000358273 12425 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 USP46-201ENST00000441222 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 NCOA2-201ENST00000452400 8447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 CYP3A43-201ENST00000222382 1515 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 TLR4-202ENST00000394487 3908 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 CLCC1-204ENST00000369968 4151 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 PLRG1-202ENST00000499023 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
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