Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 USP50-203ENST00000532404 1386 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 DCC-203ENST00000442544 10206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 UGT2B25P-201ENST00000511504 1586 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 FCGR1B-210ENST00000623603 1581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 NAALAD2-201ENST00000321955 3035 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 ACOT13-201ENST00000230048 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AC019080.1-201ENST00000397057 5202 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 SP110-204ENST00000392048 1937 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 PSMD6-AS2-201ENST00000472046 2456 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 LINC01606-203ENST00000519160 2292 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 C8orf4-201ENST00000315792 1854 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 OR2M3-202ENST00000641626 9913 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 OR2G3-201ENST00000320002 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 SPRR2A-201ENST00000392653 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 RPL5P20-201ENST00000403848 896 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 RN7SKP281-201ENST00000410472 352 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 GSTM2-205ENST00000414179 982 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 RPS26P38-201ENST00000414476 348 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AL353608.1-201ENST00000419576 416 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 Z98742.1-201ENST00000419801 632 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AL050321.1-201ENST00000432363 400 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AL139161.2-201ENST00000438371 740 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AL442224.1-201ENST00000443771 391 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 CFL1P4-201ENST00000451536 498 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AC011625.1-201ENST00000455442 526 ntTSL 4 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 RPL7P48-201ENST00000461513 746 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 RPL7P41-201ENST00000485823 957 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 SCARNA5-201ENST00000516201 276 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 EEF1B2P2-201ENST00000519625 676 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 TPT1-AS1-216ENST00000522845 403 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AC021393.1-201ENST00000531077 433 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 OR4A21P-201ENST00000532759 944 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 LINC01493-202ENST00000533575 581 ntTSL 4 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 OLR1-210ENST00000544577 924 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AC079600.1-201ENST00000550326 297 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AL357153.3-201ENST00000553982 611 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AC020891.2-201ENST00000559672 776 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AC027808.1-201ENST00000560873 683 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AC020978.2-201ENST00000563203 428 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AP003115.1-201ENST00000569849 463 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AC004034.1-201ENST00000573260 510 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AC005726.5-201ENST00000585189 298 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AP002884.5-201ENST00000595053 1132 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AC245014.3-201ENST00000618589 347 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AC018445.2-201ENST00000622987 260 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 ITGA9-AS1-218ENST00000630762 751 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 ADAM3A-207ENST00000490268 2627 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 NOX1-202ENST00000372960 2418 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AL160408.3-201ENST00000442382 3564 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AC092821.2-201ENST00000545710 2042 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 OR2AG1-202ENST00000641258 6993 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 HEMK1-203ENST00000434410 17064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 ANKS4B-201ENST00000311620 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 URI1-201ENST00000360605 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 IRAK4-203ENST00000448290 1381 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 DLC1-215ENST00000520226 3556 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 NSD3-206ENST00000527502 4471 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 IL5RA-207ENST00000438560 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 LINC02240-201ENST00000564199 1336 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 MAGEB16-203ENST00000399988 1682 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 TEAD1-205ENST00000527575 3063 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 MIER3-205ENST00000409421 2152 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 SLF2-202ENST00000370269 3712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 RN7SKP162-201ENST00000363605 345 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 DPPA2P3-201ENST00000411853 655 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 NFIA-AS2-202ENST00000421455 768 ntTSL 4 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 LINC01400-201ENST00000426358 947 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AC010890.1-202ENST00000432414 535 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 LINC01291-203ENST00000435984 565 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 Z98949.3-201ENST00000436423 472 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 PTMAP6-201ENST00000439110 327 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AL096855.1-202ENST00000444276 439 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AC002486.2-201ENST00000447806 590 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.5 ms