Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 MTUS2-AS2-202ENST00000434779 720 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AC023274.2-201ENST00000445264 521 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 GIGYF2-246ENST00000629305 7878 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 CLCN3-209ENST00000513761 6692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 MTPAP-201ENST00000263063 5601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 MED13L-201ENST00000281928 14234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 FABP3P2-201ENST00000453169 399 ntBASIC2.71□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 OR5M11-201ENST00000528616 1020 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC2.71□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AC073137.1-201ENST00000605636 634 ntBASIC2.71□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 JAKMIP2-206ENST00000616793 9272 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 GCC2-201ENST00000309863 7537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 MECOM-203ENST00000460814 3374 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 CA5A-201ENST00000309893 7567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 LPP-208ENST00000448637 5835 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 ZNF320-205ENST00000595635 6448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 SEC16A-205ENST00000371706 8093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 MTURN-202ENST00000324489 5605 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 ZDHHC20P2-201ENST00000424108 429 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 USP9YP31-201ENST00000431405 881 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AC017015.1-201ENST00000477387 286 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 SAR1B-204ENST00000502539 708 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AP003733.3-201ENST00000524942 788 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AC087477.6-201ENST00000559595 843 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 WDR7-OT1-201ENST00000592032 565 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AL359195.2-201ENST00000623657 4412 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 KLHL13-202ENST00000371876 5331 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 CORIN-201ENST00000273857 4852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 GRIK2-206ENST00000413795 4876 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 SLC7A2-202ENST00000398090 7557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 OR7C1-205ENST00000642030 11778 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 TRIM66-202ENST00000402157 10086 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AC007568.1-201ENST00000422912 471 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 LINC01133-202ENST00000443364 1266 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AC114956.1-201ENST00000504277 512 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 LINC00534-201ENST00000517400 793 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 DYNLL1P4-201ENST00000549314 266 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 KLF7-202ENST00000412414 7954 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 SNHG14-226ENST00000640631 13074 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 HIP1-201ENST00000336926 8013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 OR52N1-202ENST00000641645 2545 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 GPRIN3-201ENST00000333209 6260 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 SYNE3-205ENST00000557275 13488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 STK24-208ENST00000539966 9361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 DDX18P4-201ENST00000511690 1966 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 Z99129.3-201ENST00000624363 6430 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 SMARCA2-252ENST00000636559 6853 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 JCHAIN-201ENST00000254801 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AC098850.4-201ENST00000448331 8802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AC093719.1-202ENST00000392735 373 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AL645465.1-201ENST00000417765 642 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 MTCO1P45-201ENST00000431457 267 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AC010235.1-201ENST00000450613 547 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AC092546.1-202ENST00000505628 499 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 ELOCP35-201ENST00000604289 336 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AC239809.3-202ENST00000628902 686 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 CDK14-206ENST00000436577 4787 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 SYTL5-201ENST00000297875 4722 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 UTP14C-201ENST00000521776 5529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
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