Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AC093277.1-201ENST00000637776 1622 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 POLR1D-218ENST00000636817 4592 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 TMC1-201ENST00000297784 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 LINC01579-207ENST00000557481 3480 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 EIF3EP1-201ENST00000433978 1316 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 RASSF8-216ENST00000615708 1328 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 MEIOC-202ENST00000409464 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 ZNF292-201ENST00000339907 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 ZNF449-201ENST00000339249 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 ESF1-201ENST00000202816 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 MAGEB16-203ENST00000399988 1682 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 PHEX-AS1-201ENST00000424650 1906 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 CASC11-201ENST00000502463 3301 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 RN7SKP250-201ENST00000363924 321 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AL158212.2-201ENST00000369391 460 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 SNORA7A-201ENST00000384765 139 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 VN1R12P-201ENST00000403778 876 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AL023284.3-201ENST00000407767 334 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AL138878.2-201ENST00000440581 1241 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 GAPDHP33-201ENST00000443168 1013 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AC245291.3-201ENST00000443400 292 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 UBBP5-201ENST00000446970 266 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 SPANXB1-201ENST00000449283 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AC022498.1-201ENST00000449845 696 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 CFL1P4-201ENST00000451536 498 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 LINC02541-202ENST00000452675 465 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 SKINT1L-203ENST00000453388 749 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 RPS7P10-201ENST00000464254 603 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 VAMP3-202ENST00000470357 954 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 CPHL1P-204ENST00000482639 584 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 RPL5P14-201ENST00000494197 878 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 EIF3KP3-201ENST00000514461 639 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 RN7SKP183-201ENST00000517169 324 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AC027309.2-201ENST00000520566 192 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AC008429.2-201ENST00000523057 864 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AC078778.2-201ENST00000553061 567 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AL162632.2-201ENST00000553933 399 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 MED6-207ENST00000554963 975 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AC010809.1-201ENST00000560268 562 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AC023813.1-201ENST00000565055 306 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 MIR4271-201ENST00000582451 67 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AC026620.1-201ENST00000584815 326 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AC011500.1-201ENST00000601963 469 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AC024255.1-201ENST00000614376 102 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 LINC01709-202ENST00000635702 1204 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AC005972.4-201ENST00000636248 1131 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 LEUTX-202ENST00000638280 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 OR8G5-202ENST00000641707 1156 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 DOCK11P1-201ENST00000553480 5932 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AP002004.1-201ENST00000532510 3530 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 DNAL1-202ENST00000553645 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 ZNF337-202ENST00000376436 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AC010624.4-201ENST00000597606 1351 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AP2B1-211ENST00000610402 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 ZNF138-206ENST00000440598 2230 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 CCDC125-202ENST00000396496 4198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 ENPP3-201ENST00000357639 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 FSCB-201ENST00000340446 2938 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 TRIM64-201ENST00000533122 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 BPESC1-201ENST00000418282 3522 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 OR4N5-202ENST00000641086 2187 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 C16orf62-204ENST00000448695 3353 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 ODAM-201ENST00000396094 1319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 LYPD6B-202ENST00000409029 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 SLCO1C1-207ENST00000540354 2529 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 LINC01505-205ENST00000636028 2298 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 ST7-203ENST00000393443 2360 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 DAOA-AS1-201ENST00000448407 2482 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AL359976.1-201ENST00000418655 3528 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 MEPE-209ENST00000560249 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 ATP2C1-203ENST00000422190 3386 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 ESRRG-212ENST00000463665 3359 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 STAG3L4-201ENST00000352103 530 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
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