Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 LINC01493-201ENST00000530102 460 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 ARPP19-204ENST00000563277 955 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 CSNK1A1P1-202ENST00000563423 981 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 LINC2194-201ENST00000567127 454 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AC117569.1-201ENST00000584482 739 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AC011492.1-201ENST00000600023 315 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 BNIP3P39-201ENST00000601077 554 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AC145423.1-201ENST00000605712 336 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AC092266.1-201ENST00000610958 165 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 ELSPBP1-206ENST00000619003 893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AC016717.3-201ENST00000624730 554 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AC129915.3-201ENST00000634128 948 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AC005972.4-201ENST00000636248 1131 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 LINC01808-202ENST00000641680 1116 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 RRM1-201ENST00000300738 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AL353743.4-201ENST00000422653 1547 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 MCM8-201ENST00000265187 3442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AC007618.1-201ENST00000366455 732 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 OR7E156P-201ENST00000400303 464 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
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BRD3Q15059 SLC9B1P4-201ENST00000421957 1288 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
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BRD3Q15059 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
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BRD3Q15059 TEX41-218ENST00000596540 882 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
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BRD3Q15059 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AC124016.2-201ENST00000610058 665 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
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BRD3Q15059 MIR6071-201ENST00000616741 78 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AL512427.1-201ENST00000618593 349 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AC126544.2-201ENST00000625174 749 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AC012594.1-272ENST00000625790 710 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 LINC01955-201ENST00000626392 792 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 ZNF415-203ENST00000500065 2496 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 CASC19-261ENST00000641853 1638 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
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