Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 TNFAIP8-207ENST00000513374 1385 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 THAP12P8-201ENST00000447914 2115 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 PAK3-213ENST00000620137 2130 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 C8orf4-201ENST00000315792 1854 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 OR13G1-201ENST00000359688 1046 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 AL353625.1-202ENST00000366273 571 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 ATP5HP3-201ENST00000396994 486 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 HMGB3P7-201ENST00000400214 611 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 GLS-204ENST00000409428 816 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 MTND4LP21-201ENST00000415303 295 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 RGS17P1-201ENST00000423358 553 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 AC009365.2-201ENST00000453078 799 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 HSPE1P22-201ENST00000456856 327 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 EPDR1-204ENST00000476620 555 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 AC087664.1-201ENST00000521456 358 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 AL136298.1-202ENST00000556520 518 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 AL353770.4-201ENST00000614936 468 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 AL590491.2-203ENST00000614969 468 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 DARS-AS1-230ENST00000631306 530 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 PDE4D-229ENST00000638939 375 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 PGM3-211ENST00000512866 2013 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 UGT2B26P-201ENST00000508672 1613 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 MGP-201ENST00000228938 694 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 PLSCR2-201ENST00000336685 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 PRKACB-203ENST00000370684 869 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 F9-202ENST00000394090 1272 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 NPM1P4-201ENST00000414095 812 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 AC087380.1-202ENST00000415970 1163 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 AL031599.1-201ENST00000432694 808 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 AC092447.2-201ENST00000435487 669 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 SPRYD7P1-201ENST00000443861 570 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 ERVH-1-201ENST00000507666 639 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 LINC01088-205ENST00000509088 756 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 MTND2P17-201ENST00000550281 688 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 AC129507.1-204ENST00000573601 503 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 AC090125.1-201ENST00000581541 493 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 AC011451.1-201ENST00000591336 405 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 OR7M1P-201ENST00000608946 533 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 DNAJC10-209ENST00000613960 1010 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 FAM26D-202ENST00000368597 1311 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 AC235565.1-201ENST00000456962 1325 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 BRAFP1-201ENST00000445336 2703 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 AC115220.1-201ENST00000330020 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 CUL4AP1-201ENST00000514750 1863 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 PIH1D2-201ENST00000280350 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
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