Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 AL031601.1-201ENST00000605702 394 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 AC009163.6-201ENST00000612367 342 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 LINC01955-201ENST00000626392 792 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 AC063952.1-203ENST00000634410 658 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC8.42□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 MYO3B-202ENST00000408978 5529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 C8orf22-201ENST00000303202 1499 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 MGST1-201ENST00000010404 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 RNU6-468P-201ENST00000384003 109 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 MGST1-203ENST00000396207 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 AC104170.2-201ENST00000424246 678 ntTSL 3 BASIC8.41□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 AC062021.1-201ENST00000429008 557 ntTSL 4 BASIC8.41□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 AC023481.1-201ENST00000435368 938 ntTSL 3 BASIC8.41□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 AF127577.2-201ENST00000436429 824 ntTSL 3 BASIC8.41□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 TAS2R39-201ENST00000446620 1017 ntAPPRIS P1 BASIC8.41□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 AC008379.1-201ENST00000463655 464 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 LINC00483-204ENST00000502517 940 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC8.41□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 PSMA2P2-201ENST00000504319 686 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 GOLGA5P1-201ENST00000507317 980 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC8.41□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 TMEM68-206ENST00000519784 1009 ntTSL 3 BASIC8.41□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 AP002370.2-202ENST00000533669 908 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC8.41□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 AC004551.1-201ENST00000552784 575 ntTSL 4 BASIC8.41□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC8.41□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 GNG2-208ENST00000554875 430 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC8.41□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC8.41□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 AL049840.6-201ENST00000604583 345 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 LINC02340-201ENST00000610335 626 ntTSL 3 BASIC8.41□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 AC093875.1-201ENST00000623688 504 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 HAUS3-201ENST00000243706 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 SPINK5-203ENST00000398454 2915 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 YES1P1-201ENST00000418510 1628 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 ECM1P2-201ENST00000503354 1577 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 MIR421-201ENST00000365696 85 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 KCNJ13-202ENST00000409779 1099 ntTSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 Z99289.1-206ENST00000425503 393 ntTSL 3 BASIC8.4□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 NPM1P18-201ENST00000434232 732 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 ISCA1P2-201ENST00000438679 421 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 AC144530.1-201ENST00000452862 555 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 PEX5L-AS1-201ENST00000466064 827 ntTSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 AC108748.1-201ENST00000487772 515 ntTSL 3 BASIC8.4□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 RPS12P31-201ENST00000491419 398 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 AC106895.1-202ENST00000502956 777 ntTSL 3 BASIC8.4□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 SNORD46.2-201ENST00000516021 102 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC8.4□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 TRIM51DP-201ENST00000529746 596 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC8.4□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 C1GALT1P1-201ENST00000548895 1089 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.4□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC8.4□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 THCAT158-201ENST00000575039 535 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 COX6CP7-201ENST00000597056 208 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 AL133247.2-201ENST00000603236 482 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.6 ms