Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 AC138207.5-201ENST00000579561 409 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AL157938.2-202ENST00000588378 875 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AC027243.2-201ENST00000602530 724 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 MIR6862-1-201ENST00000613016 70 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 MIR6862-2-201ENST00000614755 70 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AGBL1-201ENST00000441037 3551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 CDC7-201ENST00000234626 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 MGC32805-205ENST00000510972 1424 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 ZNF735-201ENST00000429565 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AC130360.2-201ENST00000533477 1556 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 RNF145-201ENST00000274542 3364 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 ZNF91-202ENST00000397082 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 SLC17A4-202ENST00000397076 2331 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 ZNF490-201ENST00000311437 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AC017007.4-201ENST00000503353 1352 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AC007114.2-201ENST00000576014 4281 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 SNW1-204ENST00000554775 1687 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AL731556.1-201ENST00000394628 3711 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 IFIT2-201ENST00000371826 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 CSDE1-203ENST00000358528 4076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 CCAR1-201ENST00000265872 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 ZNF571-202ENST00000358744 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 DAOA-202ENST00000375936 742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 MYO3A-202ENST00000376301 727 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 AC092652.1-202ENST00000413315 587 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 CEACAMP8-201ENST00000413902 580 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 AL355339.1-202ENST00000417542 458 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 AL139240.1-201ENST00000422963 505 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 DSTNP5-201ENST00000427921 523 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 AL355339.1-201ENST00000434386 435 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 VN1R54P-201ENST00000435210 1049 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 AL138787.1-202ENST00000437804 898 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 AC005297.1-201ENST00000444765 862 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 LARGE-IT1-201ENST00000445391 558 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 AC002075.1-201ENST00000457396 676 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 AC073594.1-201ENST00000462065 364 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 OR2A1-AS1-202ENST00000467944 422 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 B4GALT4-AS1-201ENST00000470790 544 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 AC104971.1-201ENST00000495117 578 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 AC104109.1-201ENST00000498563 436 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 LINC00483-204ENST00000502517 940 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 LINC02505-202ENST00000510597 776 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 HMGB3P13-201ENST00000511263 607 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 SETP21-201ENST00000514799 892 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 AP002336.3-201ENST00000526017 367 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 AL132800.1-201ENST00000555109 698 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 HNRNPCP1-201ENST00000556181 766 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 AL356022.1-201ENST00000557465 483 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 CTDSPL2-204ENST00000558966 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 AC015660.3-201ENST00000559569 198 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 AC048382.2-201ENST00000560239 492 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 AC103876.1-202ENST00000561498 369 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 AC104938.1-202ENST00000563041 630 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 ZC3H7A-214ENST00000575984 2632 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 MIR3189-201ENST00000578735 73 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 NPIPB1P-202ENST00000588786 828 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 AC073218.2-202ENST00000605962 617 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 AC018690.1-201ENST00000608144 626 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 MIR6729-201ENST00000618194 65 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 SSX4B-202ENST00000619890 1092 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 SSX4-202ENST00000620320 1092 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 AL603750.1-201ENST00000624216 1717 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 AL596275.2-208ENST00000641192 594 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 MED12L-206ENST00000474524 10744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 PHEX-AS1-201ENST00000424650 1906 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 SNX18P3-202ENST00000565670 1750 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 TBC1D23-202ENST00000394144 3677 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 ADAM20-201ENST00000256389 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 ICE2P1-201ENST00000512800 1849 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 EXD1-202ENST00000458580 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 PDE4B-203ENST00000371045 3982 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 VIP-202ENST00000367244 1584 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
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