Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 AC010200.2-201ENST00000605098 235 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 AL161616.2-201ENST00000622001 565 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 LINC01020-202ENST00000508201 1800 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 IGKV7-3-201ENST00000357453 298 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 RN7SKP279-201ENST00000411383 298 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 TRGV6-201ENST00000417928 299 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 AC000095.2-201ENST00000424407 768 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 AC092168.2-201ENST00000430586 717 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 RPL12P3-201ENST00000440080 396 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 AC245047.2-201ENST00000441060 530 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 AL353093.1-201ENST00000441292 436 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 RN7SL222P-201ENST00000476452 299 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 SLC9A9-AS1-201ENST00000479030 518 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 RPS3A-210ENST00000512690 845 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 AC133963.2-201ENST00000513686 578 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 MAL2-205ENST00000521048 575 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 IGHVIII-38-1-201ENST00000521454 282 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 HMMR-AS1-202ENST00000521666 800 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 ETFRF1-202ENST00000553788 708 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 AL390334.1-201ENST00000556395 450 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 AC093510.2-201ENST00000562820 896 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 AC106785.3-201ENST00000564064 847 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 MIR3691-201ENST00000578066 90 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 DARS-AS1-211ENST00000595061 720 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 ZNF92P3-201ENST00000596594 954 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 Metazoa_SRP.170-201ENST00000616060 254 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 ZNF75A-210ENST00000617839 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 AC015726.3-201ENST00000624501 418 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 ZNF253-205ENST00000640599 1208 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 ZMYND11-209ENST00000402736 3950 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 SPHAR-201ENST00000366688 648 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 AL158825.1-201ENST00000414735 521 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 AL158050.1-201ENST00000416077 457 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 SLC35E1P1-201ENST00000419313 864 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 TMEM196-203ENST00000422233 775 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 USP24P1-201ENST00000433802 779 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 AC092013.1-201ENST00000438795 332 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 AC092685.1-201ENST00000447960 1243 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 GAPDHP14-201ENST00000450472 937 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 CYCSP42-201ENST00000450823 238 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 LINC02339-201ENST00000472649 752 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 AC004453.1-201ENST00000487895 408 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 LINC02508-201ENST00000504165 426 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 LINC02488-201ENST00000504287 652 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 RPEP1-201ENST00000504507 658 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 AC084871.1-201ENST00000508020 628 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 OR4A46P-201ENST00000527255 933 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 AC113192.3-201ENST00000529152 742 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 KCTD21-AS1-206ENST00000532831 856 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 FAXC-204ENST00000538471 941 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 AC068993.1-201ENST00000546724 589 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 HAGLR-211ENST00000549329 609 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
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