Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 AC093607.1-202ENST00000499715 559 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 LINC01612-201ENST00000504509 469 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 E2F5-204ENST00000517476 1094 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 AB015752.1-201ENST00000521975 578 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 BRD9P1-201ENST00000529855 560 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 SULT6B1-205ENST00000535679 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 AC106785.3-201ENST00000564064 847 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 ELSPBP1-205ENST00000597519 557 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 KATNBL1P5-201ENST00000605015 517 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 AL159169.2-201ENST00000610061 1269 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 OR13C3-202ENST00000641090 1108 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 OR5AC4P-202ENST00000642086 985 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 AL603750.1-201ENST00000624216 1717 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 CCT6B-203ENST00000436961 1639 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 AC004784.1-201ENST00000635495 1833 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 OR4K13-201ENST00000315693 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 NAP1L4P1-201ENST00000319092 1157 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 RNU6-1176P-201ENST00000390955 107 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 RRM2B-203ENST00000395912 900 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 RPL10P10-201ENST00000403509 664 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 AC104837.2-201ENST00000427236 424 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 AL606490.7-201ENST00000433136 191 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 AL807757.1-201ENST00000437846 424 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 SNRPFP2-201ENST00000440710 251 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 AC005518.1-201ENST00000448131 1116 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 GYG1P1-201ENST00000460864 698 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 LINC02358-201ENST00000514413 465 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 EIF3KP3-201ENST00000514461 639 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 UBE2Q2P10-201ENST00000514854 900 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 AC113423.1-201ENST00000523279 289 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 AL451137.1-201ENST00000523363 443 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 PCNPP1-201ENST00000552501 511 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 AL136298.1-201ENST00000557371 566 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 AC055855.2-201ENST00000565993 500 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 AC046158.2-201ENST00000568764 707 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 AC005021.1-201ENST00000608730 355 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 LAMTOR5-AS1-227ENST00000609653 457 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 AC025016.1-201ENST00000616746 682 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 AC105105.5-201ENST00000622635 1294 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 AC115220.1-201ENST00000330020 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 DEFB106B-201ENST00000335479 316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 AL672167.2-201ENST00000377164 879 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 RPL26P29-201ENST00000415623 438 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 AL929472.2-201ENST00000419993 481 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms