Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 SETP1-201ENST00000556014 845 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 RBM22P1-201ENST00000578589 1214 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 ANKRD20A5P-203ENST00000580200 566 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 LINC01900-202ENST00000584898 603 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AC022031.2-203ENST00000587346 565 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 TTN-AS1-245ENST00000592182 749 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AC005021.1-201ENST00000608730 355 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AC107398.4-201ENST00000635489 765 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 TMED10-201ENST00000303575 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 LINC01504-201ENST00000436054 2078 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 MRE11P1-201ENST00000464884 2127 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 PPP1R1C-201ENST00000280295 1636 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 DDX1-208ENST00000621973 2183 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 TMED3-202ENST00000424155 16555 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 OR52N5-202ENST00000641181 2778 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 LINC01204-202ENST00000435394 2214 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 HSPD1P11-201ENST00000508643 1702 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 A1CF-206ENST00000395489 9517 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 ANK2-201ENST00000264366 11775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 OR2AG1-202ENST00000641258 6993 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 KARSP3-201ENST00000571212 1504 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 CACNA1E-204ENST00000367567 14757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
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FOXF2Q12947 OR6X1-201ENST00000327930 1058 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
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FOXF2Q12947 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 TBC1D32-204ENST00000398212 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AC005323.2-201ENST00000399342 583 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
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FOXF2Q12947 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
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FOXF2Q12947 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 LINC02465-204ENST00000514892 481 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AP001972.1-201ENST00000529215 506 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
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FOXF2Q12947 AC020612.3-201ENST00000550644 570 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AL121834.1-201ENST00000572284 509 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 ZNF561-AS1-207ENST00000591932 676 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AC121761.2-201ENST00000617300 689 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 OR13C3-202ENST00000641090 1108 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
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