Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 NRP1-207ENST00000374875 5407 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 DCP2-208ENST00000515408 8029 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 MIER1-201ENST00000355356 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 INTS6-215ENST00000490542 2307 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 MAP3K20-208ENST00000539448 2312 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 TMEM87A-203ENST00000448392 3049 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 ADAM22-205ENST00000398209 9144 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 MRPS27-202ENST00000457646 2628 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 HSPA8P11-201ENST00000508840 1898 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 SUB1-201ENST00000265073 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 RFT1-201ENST00000296292 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 C7orf71-201ENST00000409974 1956 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 ZIM2-207ENST00000601070 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 MAPK10-232ENST00000515400 2076 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 SIRT5-201ENST00000359782 3797 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 RNA5SP69-201ENST00000364477 117 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 E2F4P1-201ENST00000422443 1133 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 AC004870.2-202ENST00000423781 706 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 OR2AI1P-201ENST00000448534 932 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 AL357874.2-201ENST00000457044 679 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 RN7SL749P-201ENST00000460421 290 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 AC018521.3-201ENST00000581213 816 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 COX6CP7-201ENST00000597056 208 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 AC136475.8-201ENST00000602809 386 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 uc_338.30-201ENST00000612038 168 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 SMCR2_1.1-201ENST00000621493 157 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 AL451054.1-201ENST00000621770 772 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 LINC00466-206ENST00000634576 1279 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 AL160396.1-201ENST00000637433 575 ntTSL 4 BASIC9.96□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 AL353052.2-201ENST00000441459 2241 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 TBC1D8B-206ENST00000481617 4098 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 SSBP2-201ENST00000320672 8780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 SORBS1-201ENST00000277982 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 GPR89A-213ENST00000534502 1644 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 SLC7A6-201ENST00000219343 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 MYO1E-201ENST00000288235 8673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 OR51E1-202ENST00000530215 2942 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 NVL-216ENST00000482491 3003 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 BACH2-201ENST00000257749 9113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 ARID5B-202ENST00000309334 3141 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 AL359547.1-201ENST00000419168 2190 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 LRMP-205ENST00000548766 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 AC097662.1-204ENST00000396588 2214 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 DNMBP-204ENST00000636706 5437 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 MED7-201ENST00000286317 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 LRTOMT-203ENST00000324866 2402 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 KIF13A-204ENST00000378826 5747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 SAR1A-205ENST00000373242 5981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 TBC1D31-202ENST00000327098 2985 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 AL354993.1-201ENST00000436286 3280 ntTSL 4 BASIC9.95□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 CNFN-201ENST00000222032 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 TTTY8B-201ENST00000328819 531 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 TTTY8-201ENST00000329684 531 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 OR2T6-201ENST00000355728 927 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 RNU1-7P-201ENST00000364105 164 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 RN7SKP191-201ENST00000364713 306 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 AL031777.1-201ENST00000405418 499 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 AL358176.3-201ENST00000420757 454 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 ING4-206ENST00000444704 678 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 TCEAL4P1-201ENST00000453620 588 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 POLR2CP1-201ENST00000453699 765 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 AC104619.1-201ENST00000459634 631 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 AC011476.1-201ENST00000466725 307 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 EIF3KP1-201ENST00000513279 656 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 AP002802.1-201ENST00000526154 342 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 AP003532.1-201ENST00000529936 310 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 AL442663.4-201ENST00000555304 289 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 FRG2KP-201ENST00000565692 971 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 AC024267.6-202ENST00000579187 1103 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 AC004840.2-201ENST00000603368 285 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.9 ms