Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 AC009097.3-201ENST00000563557 1018 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 AP001267.4-201ENST00000602598 545 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 AC116651.1-201ENST00000609724 556 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 RPL23AP61-201ENST00000623642 466 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 LINC01153-201ENST00000429809 2864 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 MTND4P8-201ENST00000514997 1362 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 KCNH7-205ENST00000621889 1893 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 URI1-201ENST00000360605 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 CSNK1G1-204ENST00000606793 1658 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 OFD1P8Y-201ENST00000449148 1433 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 PI15-202ENST00000523773 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 MSR1-204ENST00000381998 2826 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 OR14C36-201ENST00000317861 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 POLR1D-202ENST00000399696 668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 AL121977.1-201ENST00000401636 979 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 NACAP7-201ENST00000407371 609 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 PGAP1-203ENST00000409188 1246 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 MIR99AHG-205ENST00000435697 716 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 AC008269.1-201ENST00000438070 646 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 AP000365.1-201ENST00000438850 546 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 AC007179.2-204ENST00000444001 765 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 MTND6P5-201ENST00000448266 512 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 AL096803.2-201ENST00000450032 677 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 AL023584.2-201ENST00000454411 444 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 AC004453.1-201ENST00000487895 408 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 AP000563.1-201ENST00000490865 758 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 AC090058.1-201ENST00000498788 435 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 GYPA-203ENST00000503627 318 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 RPL26L1-203ENST00000519239 679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 AC087664.1-201ENST00000521456 358 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 OR7E128P-201ENST00000532736 1024 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 EQTN-204ENST00000537675 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 AC078820.1-201ENST00000548702 742 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 RN7SL622P-201ENST00000585292 275 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 CCDC58P3-201ENST00000590792 430 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 AC093388.1-201ENST00000609166 430 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 LINC02340-201ENST00000610335 626 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 C8orf89-201ENST00000613105 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 AC026422.1-201ENST00000623961 452 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 OR1S2-202ENST00000641683 941 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 DST-220ENST00000518935 3547 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 AC115220.1-201ENST00000330020 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 TOR1AIP1-202ENST00000435319 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 RPL9-201ENST00000295955 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 CAPZA3-201ENST00000317658 1087 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 OR8B3-201ENST00000354597 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 AC005294.1-201ENST00000355509 281 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 PAGE2B-202ENST00000374974 456 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.2 ms