Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 MTND6P5-201ENST00000448266 512 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 AC107072.1-201ENST00000449007 110 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 AL121718.1-201ENST00000449463 387 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 AL157400.3-201ENST00000449882 1298 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 RPS27AP2-201ENST00000457576 465 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 AC023141.9-201ENST00000458734 412 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 RPS4XP1-201ENST00000482189 787 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 EIF4E-204ENST00000504432 1132 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 OR10J4-201ENST00000504970 935 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 LINC02505-202ENST00000510597 776 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 AC005351.1-201ENST00000511152 786 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 SNORA19.3-201ENST00000516165 130 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 AC104212.3-201ENST00000522044 444 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 POLR2K-203ENST00000522439 543 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 AC011853.2-201ENST00000526901 774 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 AC093014.1-201ENST00000548926 724 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 LINC02406-201ENST00000553029 546 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 AC087636.1-201ENST00000554787 573 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 AL157938.2-202ENST00000588378 875 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 AP005229.2-201ENST00000609980 697 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 MIR1264-201ENST00000616374 69 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 POU2F2-219ENST00000625670 371 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 AC023421.1-201ENST00000590535 1785 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 SMARCE1-208ENST00000474246 2124 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 WDYHV1-208ENST00000523984 1491 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
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PGGT1BP53609 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
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PGGT1BP53609 CASC19-248ENST00000641674 1356 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
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PGGT1BP53609 RPL7P45-201ENST00000455851 743 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
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PGGT1BP53609 EIF1P7-201ENST00000487533 337 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 OR9N1P-202ENST00000494289 481 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 PPM1AP1-201ENST00000502740 1135 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
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PGGT1BP53609 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
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PGGT1BP53609 NMNAT1P5-201ENST00000559657 841 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 AC023825.1-201ENST00000566704 1030 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
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