Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP5HP3-201ENST00000396994 486 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 HMGB3P7-201ENST00000400214 611 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AL354794.1-201ENST00000442103 516 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 OR6C72P-201ENST00000451403 892 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AL359715.2-201ENST00000452402 682 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005412.2-201ENST00000492004 341 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 SUMO2P4-201ENST00000504193 276 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AC020551.1-201ENST00000512036 539 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AC012613.1-201ENST00000522685 387 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 MORF4L1P3-201ENST00000525966 950 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008250.1-201ENST00000539874 522 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007527.1-202ENST00000543347 382 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AL390726.5-202ENST00000564800 256 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AC012593.1-212ENST00000627058 580 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AC025428.2-201ENST00000435367 2672 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 C2orf66-201ENST00000342506 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01375-201ENST00000428485 1860 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 MDM2-201ENST00000258148 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 CCL20-201ENST00000358813 800 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 IL6-206ENST00000407492 926 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AL049812.3-201ENST00000412348 417 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 GTF2IP5-201ENST00000414608 731 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00364-201ENST00000415120 611 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AL590006.1-201ENST00000417390 752 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 TXNP5-201ENST00000441043 315 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AL023755.1-201ENST00000441851 1801 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 CYP3A43-210ENST00000444905 733 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 GAPDHP14-201ENST00000450472 937 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AC104831.1-201ENST00000470024 444 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AC239809.3-214ENST00000496508 2513 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 ICE2P1-201ENST00000512800 1849 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008147.3-201ENST00000548666 354 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02156-201ENST00000552320 483 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AC063949.1-201ENST00000552900 865 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 ETFRF1-202ENST00000553788 708 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 TVP23CP2-201ENST00000571473 623 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 MYLK-221ENST00000583087 678 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR7515HG-226ENST00000588330 1055 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 VN1R81P-201ENST00000602085 372 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AL133406.3-201ENST00000606817 541 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 LAMTOR5-AS1-227ENST00000609653 457 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AC239803.2-201ENST00000610161 430 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AC087633.2-201ENST00000618611 725 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AC003985.2-201ENST00000562268 1669 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 ECM1P2-201ENST00000503354 1577 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 MFSD4BP1-201ENST00000513330 1552 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AL603962.1-201ENST00000413148 436 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007559.1-201ENST00000428736 355 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.2 ms