Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 AC093770.1-201ENST00000511559 571 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AC109361.2-202ENST00000512514 483 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AC112191.2-201ENST00000522428 333 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 RRAS2-205ENST00000529237 1278 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AC004923.2-201ENST00000529649 369 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 MITF-217ENST00000531774 1074 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 PCED1B-AS1-203ENST00000547626 420 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 DUXAP6-201ENST00000553858 601 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 MTND4P33-201ENST00000556706 766 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 PCLAF-203ENST00000558008 766 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AC040918.1-201ENST00000560056 632 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AC010547.7-201ENST00000570323 333 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AC006116.4-201ENST00000589671 452 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AC090617.9-201ENST00000623751 147 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 ATL2-217ENST00000629272 1242 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF679-202ENST00000421025 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AC107953.2-201ENST00000518362 1408 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 IPO8-209ENST00000544829 3212 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 OR56A3-201ENST00000329564 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 MIR323A-201ENST00000362199 86 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SKP166-201ENST00000410812 305 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AC007389.1-203ENST00000414811 556 ntTSL 4 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 OSBPL10-AS1-202ENST00000418728 458 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 RPS17P17-201ENST00000419392 409 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AC092634.4-201ENST00000419937 423 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AL356056.1-206ENST00000424615 407 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 TMX2P1-201ENST00000436507 708 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 RPS7P3-201ENST00000443360 580 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AC007655.1-201ENST00000444324 357 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 NPM1P39-201ENST00000449818 867 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01952-202ENST00000450016 281 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 RBMY2TP-201ENST00000451162 947 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 RPL23AP23-201ENST00000452590 471 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 RPS6P2-201ENST00000454208 705 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AL353633.1-201ENST00000458480 382 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AC091212.1-201ENST00000474798 395 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SL174P-201ENST00000475578 289 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AC124893.1-201ENST00000496247 545 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AC114956.1-201ENST00000504277 512 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AC006296.2-201ENST00000507932 764 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AC010406.1-201ENST00000507948 555 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AC118282.2-201ENST00000508739 374 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 NPY1R-204ENST00000509586 1017 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AC006530.1-201ENST00000555980 571 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AC025918.2-201ENST00000558683 763 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AC007494.1-201ENST00000562293 760 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AC007599.1-201ENST00000568688 1174 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AC005034.4-201ENST00000603612 899 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 RDM1-219ENST00000615378 542 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 CCL4-202ENST00000615863 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF177-202ENST00000589262 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 MEPE-209ENST00000560249 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4500HG-201ENST00000436290 1675 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 FLJ12825-201ENST00000515617 3942 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms