Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 MTND3P4-201ENST00000453537 303 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 TSACC-207ENST00000470342 601 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 AC097173.1-201ENST00000505862 819 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 AC008638.1-201ENST00000506035 866 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 AC097512.1-203ENST00000506425 957 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 MGST2-204ENST00000506797 634 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 JCHAIN-204ENST00000510437 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 AC012414.2-201ENST00000559474 187 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 AC092683.1-203ENST00000594050 654 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 MIMT1-201ENST00000597105 1050 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 BNIP3P35-201ENST00000604530 490 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 AP005131.7-201ENST00000610087 611 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 AL139407.1-201ENST00000613826 1175 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 ZNF479-203ENST00000620639 1239 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 LAMTOR5-AS1-233ENST00000625451 470 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 ATL2-217ENST00000629272 1242 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 TRAT1-202ENST00000426646 1596 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 OR8D4-201ENST00000321355 1331 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 DEFB128-201ENST00000334391 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 AMELX-201ENST00000348912 737 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 ATP6V1G3-203ENST00000367382 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 AL590806.1-201ENST00000415818 853 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 AL645465.1-201ENST00000417765 642 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 AC005033.1-201ENST00000428904 813 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 AC018467.1-203ENST00000440785 506 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
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COPS7AQ9UBW8 AC011287.2-201ENST00000456809 842 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
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COPS7AQ9UBW8 LINC01192-207ENST00000492553 836 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
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COPS7AQ9UBW8 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 AC006511.5-202ENST00000546339 1198 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
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COPS7AQ9UBW8 AL050403.2-203ENST00000603180 558 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
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COPS7AQ9UBW8 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 TEX41-254ENST00000626394 423 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 IQCH-214ENST00000629425 1822 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 CYP3A43-203ENST00000342499 1396 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 WDR89-201ENST00000267522 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
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