Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 NOSTRIN-207ENST00000445023 1569 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 AL132640.2-201ENST00000559968 1698 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 TAS2R10-201ENST00000240619 1042 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 C8orf22-201ENST00000303202 1499 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 PRKACB-203ENST00000370684 869 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 ATXN10-203ENST00000402380 564 ntTSL 4 BASIC7.65□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 TCEA1P4-201ENST00000415066 844 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 NLGN1-AS1-201ENST00000423873 815 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 AL080316.1-201ENST00000432438 499 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 CYP4F27P-201ENST00000514557 494 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 AC093535.1-201ENST00000515808 747 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 AC027419.2-201ENST00000518439 497 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 ANGPT1-205ENST00000520052 1523 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 LINC02267-202ENST00000522173 799 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 MTND1P6-201ENST00000523621 946 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 GPRC5D-AS1-205ENST00000540198 404 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC7.65□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 AC090666.1-201ENST00000578241 445 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 AC092316.1-201ENST00000598703 297 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 AC097717.1-250ENST00000608498 273 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 MKKS-203ENST00000609375 882 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 AC245088.3-201ENST00000634383 424 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 CRNDE-213ENST00000635991 546 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 AC006927.2-201ENST00000639256 389 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 ZNF253-205ENST00000640599 1208 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 KCNRG-202ENST00000360473 1623 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 HIST1H1A-201ENST00000244573 648 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 RBMS3-AS2-201ENST00000366321 582 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 CLEC7A-206ENST00000396484 1000 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 AL365184.1-201ENST00000413801 572 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 VTA1P1-201ENST00000414044 866 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 AL138733.1-201ENST00000415477 853 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 AC104389.1-201ENST00000418080 522 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 FO393414.1-201ENST00000428697 1184 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 AL049749.1-201ENST00000430281 632 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 AL137076.1-201ENST00000441046 551 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
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USP35Q9P2H5 IGKV2D-10-201ENST00000520194 281 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
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USP35Q9P2H5 YWHAZP1-201ENST00000556286 722 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 AC022929.1-201ENST00000560675 823 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 AGGF1P7-201ENST00000562369 913 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 ARL2BPP3-202ENST00000580773 420 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 MIR4646-201ENST00000580775 63 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 BNIP3P40-201ENST00000596017 556 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 LINC02098-202ENST00000609260 554 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 AP003497.2-201ENST00000624220 967 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 LINC01020-202ENST00000508201 1800 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 MAPK10-341ENST00000641657 3860 ntAPPRIS P2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
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