Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 CASP12-206ENST00000446862 1196 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 YWHAEP1-201ENST00000453697 763 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC004129.2-201ENST00000457229 287 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC073636.1-202ENST00000457756 558 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC004692.2-203ENST00000458590 497 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC023141.9-201ENST00000458734 412 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 RN7SL423P-201ENST00000486202 304 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 IMPA1P1-201ENST00000510718 842 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC093248.1-201ENST00000513197 417 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC027308.1-201ENST00000517993 110 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC018793.4-201ENST00000524542 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AP003717.3-201ENST00000544832 1180 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC007424.1-205ENST00000552615 579 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AL357172.1-201ENST00000556016 593 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AL390334.1-201ENST00000556395 450 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC068722.1-202ENST00000559600 655 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC023825.1-201ENST00000566704 1030 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 RBM22P12-201ENST00000567098 1255 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 MIR4443-201ENST00000585052 53 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 CXXC1P1-203ENST00000589302 746 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC010463.2-201ENST00000597592 661 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC096947.1-201ENST00000603233 470 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC023762.1-201ENST00000603280 584 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AL160400.1-201ENST00000606385 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC242426.3-203ENST00000606757 712 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC090912.3-201ENST00000609775 533 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 RN7SL787P-201ENST00000613000 284 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC007527.2-201ENST00000621825 546 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC073342.3-201ENST00000624211 193 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 OR4G3P-201ENST00000633500 913 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 PIGX-210ENST00000639143 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC018793.2-201ENST00000639584 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC013437.2-201ENST00000639587 677 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC018793.3-201ENST00000640805 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC073869.7-201ENST00000640874 297 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC087565.3-203ENST00000641018 837 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 ZNF480-204ENST00000490272 2238 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AL138828.1-203ENST00000419926 1570 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 LINC00919-201ENST00000561513 1658 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 IL6ST-212ENST00000522633 1878 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 DEFB118-201ENST00000253381 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 APOOL-201ENST00000373173 1279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC234772.1-201ENST00000377927 937 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 U3.25-201ENST00000391209 220 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 RMRPP5-201ENST00000411156 267 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AL513325.1-201ENST00000417716 1034 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC241520.1-201ENST00000422654 1099 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AL022331.1-201ENST00000429025 477 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 RPL34P6-201ENST00000432390 345 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AL359265.1-201ENST00000440296 795 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC104653.1-202ENST00000446401 390 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC092685.1-201ENST00000447960 1243 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 LINC00704-203ENST00000449712 703 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 LRRC37A14P-201ENST00000452297 462 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 RPS27AP2-201ENST00000457576 465 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC078883.3-201ENST00000458314 512 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 RPS27L-205ENST00000462430 681 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC025566.1-201ENST00000477153 490 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AL136038.1-201ENST00000497246 351 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC092916.1-201ENST00000497896 411 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC069306.1-201ENST00000507006 843 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC011389.1-203ENST00000513790 573 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 GPX8-208ENST00000515370 1036 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 LINC00535-202ENST00000517785 264 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AP003110.1-201ENST00000526976 717 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 NPM1P35-201ENST00000533043 868 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC090022.1-201ENST00000546569 311 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms