Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 BCL2A1-202ENST00000335661 809 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 TANK-203ENST00000402568 878 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 MIR1286-201ENST00000408112 78 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 SEPT7P8-201ENST00000413308 775 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 GTF3AP1-201ENST00000416942 1004 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 OR5M12P-201ENST00000423388 929 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 SETP10-201ENST00000424368 814 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 LINC01400-201ENST00000426358 947 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 MTCO1P51-201ENST00000427672 1060 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 GTF3AP5-201ENST00000442645 697 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 AC020559.1-201ENST00000444229 583 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 MTND6P5-201ENST00000448266 512 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 AC036101.1-201ENST00000449272 597 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 RPL31P20-201ENST00000449593 360 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 AP003774.2-202ENST00000449694 341 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 AP000472.1-201ENST00000452500 530 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 DAP3-209ENST00000465375 729 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 AC010350.1-201ENST00000504908 231 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 RNU6-319P-201ENST00000516025 108 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 UQCRB-209ENST00000523920 695 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 GTF2H1-208ENST00000526630 932 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 LINC00871-202ENST00000556071 554 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 NOP10-202ENST00000557912 436 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 AC022196.1-202ENST00000559570 462 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 AC007225.2-201ENST00000562529 256 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 ZNF561-AS1-207ENST00000591932 676 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 Metazoa_SRP.170-201ENST00000616060 254 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 AC037198.3-201ENST00000616754 526 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 AC099494.2-201ENST00000623371 978 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 AP000720.1-201ENST00000625091 483 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 AL162425.1-201ENST00000423637 1525 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 AC024341.1-201ENST00000526444 1552 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 AC019072.1-201ENST00000604535 1551 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 RNF217-202ENST00000368414 1771 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 SLC38A9-218ENST00000512595 1756 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 FASTKD3-201ENST00000264669 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 CCDC169-202ENST00000239860 716 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 FAR1P1-201ENST00000427163 934 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 AL583785.1-201ENST00000428006 512 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 LINC02257-202ENST00000433576 720 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 MTND4P15-201ENST00000437913 1033 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 C21orf91-OT1-203ENST00000439392 497 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 TCEA1P1-201ENST00000449716 880 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 RPS4XP12-201ENST00000461747 709 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 RN7SL222P-201ENST00000476452 299 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 RWDD4P1-201ENST00000488019 565 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 RPS4XP14-201ENST00000493072 781 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 AC105460.2-202ENST00000502936 825 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 AC097515.1-202ENST00000511818 371 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 ZCCHC10-210ENST00000513848 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 AC021733.1-201ENST00000519786 325 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 AC074029.2-201ENST00000551045 634 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 AC087636.1-201ENST00000554787 573 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 MIR3176-201ENST00000582210 90 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 AC008794.2-201ENST00000587779 293 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 AC105254.2-201ENST00000603636 436 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 QTRT1P1-201ENST00000604344 1078 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 SATB1-AS1-243ENST00000627546 589 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 SLC26A5-208ENST00000393730 2498 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 AL022393.1-201ENST00000625142 1677 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 ABCA6-206ENST00000590645 1511 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 OR2AE1-201ENST00000316368 1071 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99 ms