Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

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Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 VDAC1P6-201ENST00000430062 855 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC93Q567U6 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC93Q567U6 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC93Q567U6 LINC01878-201ENST00000434559 769 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC93Q567U6 Z82198.2-201ENST00000434741 567 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC93Q567U6 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC93Q567U6 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC93Q567U6 AL138878.2-201ENST00000440581 1241 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC93Q567U6 RPL7P16-201ENST00000479738 738 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC93Q567U6 OR11I1P-201ENST00000486033 954 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC93Q567U6 GTF2F2P1-201ENST00000511083 675 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC93Q567U6 LINC00616-203ENST00000512536 568 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC93Q567U6 RNU6-319P-201ENST00000516025 108 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC93Q567U6 RN7SKP253-201ENST00000516424 309 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC93Q567U6 RNU6-889P-201ENST00000517189 103 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC93Q567U6 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC93Q567U6 OR4V1P-201ENST00000525394 1140 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC93Q567U6 AP000619.2-201ENST00000546014 969 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC93Q567U6 LINC02313-201ENST00000553330 550 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC93Q567U6 AC025917.1-201ENST00000562062 612 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC93Q567U6 FOPNL-207ENST00000575073 530 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC93Q567U6 HAUS1-203ENST00000585518 506 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC93Q567U6 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC93Q567U6 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC93Q567U6 AC034236.3-201ENST00000605999 461 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC93Q567U6 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC93Q567U6 AC005156.1-201ENST00000613371 573 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC93Q567U6 OSER1-AS1-205ENST00000623343 827 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC93Q567U6 AC112694.2-201ENST00000623697 768 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC93Q567U6 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC93Q567U6 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC93Q567U6 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC93Q567U6 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC93Q567U6 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC93Q567U6 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC93Q567U6 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC93Q567U6 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC93Q567U6 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC93Q567U6 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC93Q567U6 MGP-203ENST00000539261 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC93Q567U6 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC93Q567U6 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC93Q567U6 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC93Q567U6 AL627171.1-201ENST00000618845 1308 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
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CCDC93Q567U6 RPSAP35-201ENST00000413753 818 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC93Q567U6 AF064860.1-201ENST00000416555 544 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
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CCDC93Q567U6 TXNDC12-AS1-201ENST00000428794 391 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC93Q567U6 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
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CCDC93Q567U6 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC93Q567U6 AP2B1-222ENST00000628168 192 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC93Q567U6 AL356118.1-201ENST00000635272 1078 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC93Q567U6 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC93Q567U6 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC93Q567U6 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC93Q567U6 RNF145-201ENST00000274542 3364 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC93Q567U6 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC93Q567U6 CYP2C8-210ENST00000535898 1799 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC93Q567U6 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
CCDC93Q567U6 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
CCDC93Q567U6 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
CCDC93Q567U6 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
CCDC93Q567U6 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC93Q567U6 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC93Q567U6 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC93Q567U6 RLIMP2-201ENST00000427891 1563 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC93Q567U6 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC93Q567U6 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC93Q567U6 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC93Q567U6 RN7SKP149-201ENST00000363008 344 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC93Q567U6 MANSC4-201ENST00000381273 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC93Q567U6 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC93Q567U6 KCNJ13-203ENST00000410029 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC93Q567U6 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC93Q567U6 GJA6P-201ENST00000415117 1042 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC93Q567U6 TRIM60P17-201ENST00000415181 719 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC93Q567U6 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC93Q567U6 AF230666.1-201ENST00000429151 786 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
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