Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 UBE2L5P-201ENST00000436446 465 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 SETD6P1-201ENST00000444575 317 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 RBBP6-204ENST00000452655 854 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AC093801.1-201ENST00000504017 307 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AC097460.1-204ENST00000515026 764 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 HAUS1P3-201ENST00000523909 662 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 RGS5-219ENST00000528019 512 ntTSL 4 BASIC6.77□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AP001318.3-202ENST00000528876 509 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AC090424.1-201ENST00000535243 736 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AC007346.2-201ENST00000564816 892 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AC021422.1-201ENST00000621212 473 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC6.77□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AC126544.2-201ENST00000625174 749 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 LINC01951-201ENST00000377300 1925 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 PTER-202ENST00000378000 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 GTF2H5-201ENST00000607778 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 RNF146-215ENST00000616343 2077 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AL645568.2-201ENST00000432815 1337 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AC093277.1-201ENST00000637776 1622 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 PLCE1-203ENST00000371385 6500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 TTC3-201ENST00000354749 9084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 PHYHIPL-201ENST00000373878 3569 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 CSDE1-203ENST00000358528 4076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 OR7G2-201ENST00000305456 1038 ntAPPRIS P2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 MRRF-203ENST00000373723 1176 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 SNX24-202ENST00000395451 1050 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AP002530.1-201ENST00000405705 684 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 LINC00867-202ENST00000415417 488 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AL353771.1-201ENST00000422107 457 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AL592293.2-201ENST00000422292 996 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 TRGV7-201ENST00000427089 353 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 LINC01745-201ENST00000430921 372 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 MRPL50P1-201ENST00000431951 384 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AC009963.4-201ENST00000448535 339 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 SEPT7P6-201ENST00000469999 1143 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 LINC00977-201ENST00000509893 1163 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 LINC00500-201ENST00000515860 539 ntTSL 4 BASIC6.76□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 LINC02365-202ENST00000520280 607 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 TMEM68-214ENST00000523073 536 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 SNHG1-205ENST00000537869 1038 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 YWHABP2-201ENST00000540201 713 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 ARPP19-204ENST00000563277 955 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 PWRN3-201ENST00000566797 849 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 PDZPH1P-202ENST00000602846 722 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AC025175.1-201ENST00000606482 759 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AL355974.3-201ENST00000617383 467 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 DLG2-AS1_1.1-201ENST00000622319 213 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 SUPT3H-206ENST00000637763 498 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 MIR3681HG-201ENST00000412294 2183 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 GRIA3-207ENST00000620443 4943 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 FSTL5-201ENST00000306100 4831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AC110373.1-201ENST00000505994 3505 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 LINC01981-201ENST00000432163 2833 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 CNTN5-204ENST00000524871 6258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 RRN3-202ENST00000327307 2039 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AC120338.1-201ENST00000625074 1541 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AASDH-203ENST00000502617 3004 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 CCDC186-203ENST00000369287 7245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 TNKS-206ENST00000518281 3897 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 XKRY2-202ENST00000623874 1581 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 XKRY-202ENST00000624960 1581 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AC007562.1-201ENST00000421819 517 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AL390879.1-201ENST00000439143 386 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.8 ms