Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 OR10AB1P-202ENST00000641219 1686 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 KIAA1328-202ENST00000586135 1863 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 AP002530.1-201ENST00000405705 684 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 PCNPP4-201ENST00000414817 517 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 GNG12-AS1-202ENST00000414904 796 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 AC004980.3-201ENST00000447046 365 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 AC004994.1-201ENST00000447057 313 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 AL731574.1-201ENST00000447757 456 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 AL034380.1-201ENST00000448791 306 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 AL137005.1-201ENST00000452944 719 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 AC093763.1-201ENST00000512464 699 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 LINC02429-202ENST00000513836 694 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 ACTR6P1-201ENST00000514311 1104 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 RBPMS-207ENST00000519647 780 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 AC025423.4-201ENST00000553141 785 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 AC092134.1-201ENST00000563690 800 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 AC004948.1-201ENST00000609858 672 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 LINC02266-201ENST00000610239 1151 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 AL445528.2-201ENST00000620582 470 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 AC020763.5-201ENST00000623298 430 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 PCDHB2-203ENST00000624874 565 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 OR51F2-202ENST00000641672 1136 ntAPPRIS P2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 LINC00507-201ENST00000540882 1935 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 CCT6B-203ENST00000436961 1639 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 DNAJC28-202ENST00000381947 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 PAK3-213ENST00000620137 2130 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 PHTF2-207ENST00000424760 1977 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 OR4C11-201ENST00000302231 1045 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 MIR365B-201ENST00000362317 111 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 SEPT7P8-201ENST00000413308 775 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 AC096669.1-202ENST00000413708 616 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 ARSD-AS1-201ENST00000414053 816 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 TRIM60P13-201ENST00000432350 1283 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 AC046176.1-201ENST00000435260 1170 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 ARPP21-218ENST00000438071 1103 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 PA2G4P6-201ENST00000438325 1197 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 AC068491.2-201ENST00000438897 617 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 AL353764.1-201ENST00000442072 474 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 AC099654.1-201ENST00000442649 407 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 AC073648.4-201ENST00000442655 781 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 RAB28P3-201ENST00000448325 597 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 TCEA1P1-201ENST00000449716 880 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 AL450344.1-201ENST00000456018 639 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 RPL35AP28-201ENST00000459730 331 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 AC105918.1-201ENST00000474399 838 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 AC022336.1-201ENST00000475510 337 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 AC012055.1-201ENST00000511346 1144 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 AC090753.1-201ENST00000522087 331 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 NELL2-211ENST00000548826 559 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 PCNPP1-201ENST00000552501 511 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 BCAR4-204ENST00000573319 1273 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 AC027281.1-201ENST00000574178 758 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 MTCYBP13-201ENST00000578634 1093 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 AC005084.1-201ENST00000605160 304 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 AC026367.3-201ENST00000619032 590 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 AC243829.4-201ENST00000620056 701 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 AC091932.2-201ENST00000623014 291 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 AJ009632.2-203ENST00000634708 1205 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 CNOT6LP1-201ENST00000559681 1462 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 LCA5L-203ENST00000380671 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 IGF2BP3-218ENST00000619562 2126 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 SMARCA2-206ENST00000382185 1584 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 AC008505.1-203ENST00000637345 1766 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.1 ms