Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 AL137058.3-201ENST00000624531 3099 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 ALG10B-201ENST00000308742 10253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 SLAMF6-201ENST00000368055 730 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 HMGB3P19-201ENST00000403971 560 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 RBMS3-AS1-201ENST00000414547 554 ntTSL 4 BASIC8.43□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 ZNF736P2Y-201ENST00000416040 1279 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 AC068631.1-204ENST00000428501 534 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 AC099654.1-201ENST00000442649 407 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 AC011476.1-201ENST00000466725 307 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 LINC02006-201ENST00000488210 524 ntTSL 4 BASIC8.43□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 AC080014.1-201ENST00000496877 1201 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 LINC01455-201ENST00000503167 561 ntTSL 4 BASIC8.43□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 GPX8-208ENST00000515370 1036 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 RNU6-889P-201ENST00000517189 103 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 LINC01151-201ENST00000521608 571 ntTSL 4 BASIC8.43□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 AP004609.2-201ENST00000532177 190 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 AC092868.3-201ENST00000560515 784 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 LINC02131-201ENST00000563289 419 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 U95743.1-201ENST00000573369 1001 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 AC099850.2-201ENST00000577660 557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 AL136311.1-213ENST00000586466 520 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 LINC00663-202ENST00000586816 306 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 AC100767.2-201ENST00000604840 693 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 AC010245.2-201ENST00000606908 1167 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 CCL4-202ENST00000615863 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 AC067852.7-201ENST00000623270 535 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 AD000090.1-201ENST00000638356 494 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 METTL8-218ENST00000638989 876 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 METTL8-219ENST00000640734 726 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC8.43□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 TRIM77-201ENST00000398290 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 C3orf35-203ENST00000425564 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC8.43□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 CCDC178-202ENST00000383096 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 KCNQ3-205ENST00000621976 10659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 OR2B6-201ENST00000244623 942 ntAPPRIS P1 BASIC8.42□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 TRAV10-201ENST00000390432 379 ntAPPRIS P1 BASIC8.42□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC8.42□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 MTND4LP21-201ENST00000415303 295 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 AC093422.3-201ENST00000428506 305 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 IFNNP1-201ENST00000429219 553 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 RPS7P2-201ENST00000435134 607 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 AL139161.2-201ENST00000438371 740 ntTSL 3 BASIC8.42□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC8.42□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 AL355601.1-201ENST00000444701 427 ntTSL 3 BASIC8.42□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 AC073109.1-201ENST00000445066 978 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 NDUFAF4P2-201ENST00000445374 520 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 AC044797.1-201ENST00000445744 679 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 OR5H3P-201ENST00000502817 919 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC8.42□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 AF250324.1-203ENST00000508156 517 ntTSL 3 BASIC8.42□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 snoU109.5-201ENST00000516231 132 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 UQCRB-204ENST00000518406 595 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 HMGN2P36-201ENST00000529541 409 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 AP000648.1-201ENST00000529682 397 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 OR52E8-201ENST00000537935 1061 ntAPPRIS P1 BASIC8.42□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 AC020612.3-201ENST00000550644 570 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 ZNF322P1-201ENST00000568013 1209 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 AC015802.2-201ENST00000589690 189 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 AC115522.1-201ENST00000595680 556 ntTSL 4 BASIC8.42□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
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