Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 IGBP1P4-201ENST00000503202 879 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AC010425.1-201ENST00000511734 554 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AC026719.2-201ENST00000515656 295 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AC124067.3-201ENST00000522643 847 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AC013644.1-202ENST00000523166 499 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 OR4A43P-201ENST00000532938 908 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 NOP10-202ENST00000557912 436 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AC009117.3-202ENST00000563825 557 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AC015845.2-201ENST00000581805 472 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 BNIP3P32-201ENST00000600015 554 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 LINC00632-204ENST00000602830 597 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AC012467.1-201ENST00000607740 256 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AC243654.3-201ENST00000617427 735 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AC015722.2-201ENST00000622210 551 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AC021106.3-201ENST00000623925 531 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 OR2L5-201ENST00000355281 2429 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 OR8I2-201ENST00000302124 1010 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 RGS10-201ENST00000369101 738 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 IFNA21-201ENST00000380225 1024 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
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SGCGQ13326 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
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SGCGQ13326 C1DP3-201ENST00000455013 423 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AC117383.1-201ENST00000507698 422 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
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SGCGQ13326 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AP002518.2-201ENST00000544925 393 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
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SGCGQ13326 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
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SGCGQ13326 AC133644.2-201ENST00000608142 540 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AC105402.3-203ENST00000608822 885 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AC004948.1-201ENST00000609858 672 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 Metazoa_SRP.55-201ENST00000618452 275 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 TEX41-254ENST00000626394 423 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 CYP3A43-203ENST00000342499 1396 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
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