Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 AC003975.1-201ENST00000411856 837 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AC007562.1-201ENST00000421819 517 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 HIGD1AP12-201ENST00000427832 281 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 MOB1AP1-201ENST00000430903 535 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AC023274.2-201ENST00000445264 521 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AURKAPS1-201ENST00000451805 1212 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AC246785.3-201ENST00000455105 314 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 ALG13-211ENST00000473389 693 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AC108941.1-201ENST00000502853 530 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AC011411.1-201ENST00000509592 876 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AC021146.7-201ENST00000509604 775 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 CYP4F27P-201ENST00000514557 494 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AL133485.1-201ENST00000555966 392 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AC002091.1-201ENST00000578788 557 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AC015878.1-201ENST00000584611 679 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 MRO-208ENST00000588444 866 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 ZRANB2-AS2-212ENST00000590186 686 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 LINC01676-204ENST00000595309 871 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AL121873.1-201ENST00000616013 524 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 REV3L-214ENST00000619481 969 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 MIR6886-201ENST00000619864 61 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AC011287.1-204ENST00000640300 1213 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 ABL2-201ENST00000344730 6910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 IPCEF1-201ENST00000265198 6689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 FOXM1-202ENST00000359843 3315 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 CCDC77-201ENST00000239830 2371 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 GJC1-207ENST00000590758 7566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 KCNN3-205ENST00000618040 13057 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 EIF5AL1-201ENST00000520547 3840 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AL591848.4-201ENST00000567832 3472 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AC093010.2-202ENST00000493033 3023 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 DHRS9-205ENST00000432060 1652 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 TRRAP-207ENST00000628380 12644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 SELE-201ENST00000333360 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 EZH1-202ENST00000428826 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 CTNNA2-202ENST00000361291 3071 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 LINC01606-203ENST00000519160 2292 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 LINC02153-202ENST00000522604 1644 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 BDNF-203ENST00000395978 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 BDNF-207ENST00000395986 3979 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 TMSB4XP4-201ENST00000323496 618 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 SNORD8-201ENST00000363915 110 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AC008171.1-201ENST00000395058 200 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 RN7SKP166-201ENST00000410812 305 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AC007389.1-203ENST00000414811 556 ntTSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 ISM1-AS1-201ENST00000431407 652 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AL445928.1-201ENST00000435545 222 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 Z99127.2-201ENST00000441426 334 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 RPS7P3-201ENST00000443360 580 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 RN7SL174P-201ENST00000475578 289 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AC094108.1-201ENST00000502494 527 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 MOCS2-205ENST00000508922 1210 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 HMGB3P13-201ENST00000511263 607 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AC025366.1-201ENST00000523264 202 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 CREBZF-209ENST00000534224 545 ntTSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AL163195.3-202ENST00000555283 578 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AC137800.1-201ENST00000562976 573 ntTSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 OR4H6P-201ENST00000563771 921 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AC103810.5-201ENST00000581622 560 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AC067852.5-201ENST00000589299 310 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 ZNF106-201ENST00000263805 10460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 ZNF679-202ENST00000421025 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 FCGR1B-209ENST00000616817 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 RABGEF1-202ENST00000380828 3864 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 LY86-AS1-202ENST00000435641 2819 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 KCNJ15-220ENST00000612702 3046 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 HTR4-206ENST00000520086 2272 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
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