Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
NME3Q13232 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NME3Q13232 AC112255.1-201ENST00000624070 2493 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NME3Q13232 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NME3Q13232 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NME3Q13232 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NME3Q13232 DTNA-227ENST00000597599 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NME3Q13232 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NME3Q13232 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
NME3Q13232 RBMS1-203ENST00000409075 1550 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
NME3Q13232 ECM1P2-201ENST00000503354 1577 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NME3Q13232 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NME3Q13232 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
NME3Q13232 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NME3Q13232 OR8I2-201ENST00000302124 1010 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NME3Q13232 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NME3Q13232 AL589647.1-201ENST00000402485 466 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NME3Q13232 AL021331.1-201ENST00000402817 582 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NME3Q13232 AL136116.2-201ENST00000404020 785 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NME3Q13232 AL445213.1-201ENST00000412589 747 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NME3Q13232 NPM1P40-201ENST00000412758 733 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NME3Q13232 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NME3Q13232 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NME3Q13232 DPH5-204ENST00000427040 609 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
NME3Q13232 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NME3Q13232 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NME3Q13232 AC073052.1-201ENST00000440417 714 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NME3Q13232 AC012512.1-201ENST00000446594 718 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NME3Q13232 AC239798.3-201ENST00000454459 408 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NME3Q13232 AL035446.1-201ENST00000455011 453 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NME3Q13232 RPL32P9-201ENST00000487963 407 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NME3Q13232 EEF1A1P25-201ENST00000495704 1267 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NME3Q13232 AC124242.1-202ENST00000499554 1052 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NME3Q13232 NADK2-AS1-201ENST00000501794 720 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
NME3Q13232 AC115622.1-201ENST00000509628 587 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NME3Q13232 AC106894.1-201ENST00000511735 451 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NME3Q13232 AC020937.1-201ENST00000519677 1013 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NME3Q13232 AC079296.1-202ENST00000521394 960 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NME3Q13232 AL078612.2-201ENST00000525133 646 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NME3Q13232 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NME3Q13232 AC137590.1-201ENST00000542422 495 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NME3Q13232 ARPP19-204ENST00000563277 955 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NME3Q13232 AC007014.1-201ENST00000572828 610 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NME3Q13232 AC021549.1-201ENST00000580937 433 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NME3Q13232 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NME3Q13232 AL391597.1-201ENST00000618707 694 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NME3Q13232 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NME3Q13232 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NME3Q13232 CDC14A-206ENST00000635056 2056 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NME3Q13232 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NME3Q13232 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
NME3Q13232 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NME3Q13232 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
NME3Q13232 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NME3Q13232 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NME3Q13232 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NME3Q13232 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NME3Q13232 IL13RA2-201ENST00000243213 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NME3Q13232 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NME3Q13232 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NME3Q13232 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NME3Q13232 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NME3Q13232 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NME3Q13232 MGC32805-205ENST00000510972 1424 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NME3Q13232 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NME3Q13232 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NME3Q13232 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NME3Q13232 GLYAT-201ENST00000278400 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NME3Q13232 ELOC-201ENST00000284811 683 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NME3Q13232 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NME3Q13232 RNU6-697P-201ENST00000363348 107 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NME3Q13232 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NME3Q13232 AP002530.1-201ENST00000405705 684 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NME3Q13232 AC098820.3-201ENST00000414135 976 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NME3Q13232 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NME3Q13232 AC004415.1-201ENST00000422697 449 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NME3Q13232 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NME3Q13232 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NME3Q13232 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NME3Q13232 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NME3Q13232 MRPL35P2-201ENST00000448009 511 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NME3Q13232 TRY2P-201ENST00000448860 689 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NME3Q13232 PCBP1-AS1-237ENST00000452431 1194 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NME3Q13232 AC093270.2-201ENST00000486157 792 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NME3Q13232 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NME3Q13232 RGS5-219ENST00000528019 512 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NME3Q13232 AP001804.2-201ENST00000533932 910 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NME3Q13232 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NME3Q13232 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NME3Q13232 AC131274.1-201ENST00000582507 254 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NME3Q13232 UBA52-209ENST00000597451 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NME3Q13232 LINC02112-204ENST00000606222 429 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NME3Q13232 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NME3Q13232 AP000648.2-201ENST00000624182 404 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NME3Q13232 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NME3Q13232 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NME3Q13232 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NME3Q13232 TAF9-205ENST00000506736 1331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NME3Q13232 AC068446.1-201ENST00000556425 1549 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NME3Q13232 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
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