Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 AL021940.1-201ENST00000454271 677 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 APOOP2-201ENST00000461561 539 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 AC068228.1-201ENST00000461723 211 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 HMGN1P8-201ENST00000463578 288 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 RPS4XP18-201ENST00000495480 763 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 AC018797.1-201ENST00000510791 255 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 AC010425.1-201ENST00000511734 554 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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BNIP1Q12981 AC087379.1-201ENST00000524613 993 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 AP003031.2-204ENST00000527219 567 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 AC005000.1-201ENST00000536192 288 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 AC078878.1-201ENST00000539832 958 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 AP000897.2-201ENST00000579509 1057 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 AC006116.4-201ENST00000589671 452 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 AC006237.1-201ENST00000603816 480 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 AL135786.2-201ENST00000608422 615 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 DUXB-201ENST00000633875 1079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 OR8G3P-202ENST00000641572 1255 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 ECM1P2-201ENST00000503354 1577 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 ARPP21-202ENST00000396481 1304 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 FPGT-208ENST00000534056 1426 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 TNFSF11-202ENST00000358545 1520 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
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BNIP1Q12981 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
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BNIP1Q12981 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 HSPD1P11-201ENST00000508643 1702 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
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BNIP1Q12981 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
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BNIP1Q12981 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 GPR89A-213ENST00000534502 1644 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 OR5F1-201ENST00000278409 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 OR4C11-201ENST00000302231 1045 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 COX6B1P3-201ENST00000312310 260 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 ODF3-202ENST00000342593 386 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 RNU6-386P-201ENST00000362650 107 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 RN7SKP171-201ENST00000364417 303 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
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