Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BGRP55822 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BGRP55822 RPL27-207ENST00000590864 569 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BGRP55822 AC011990.1-201ENST00000592809 734 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BGRP55822 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BGRP55822 AL158196.1-201ENST00000616786 434 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BGRP55822 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BGRP55822 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BGRP55822 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BGRP55822 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BGRP55822 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BGRP55822 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BGRP55822 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BGRP55822 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BGRP55822 AL355306.2-205ENST00000635395 1646 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BGRP55822 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BGRP55822 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BGRP55822 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SH3BGRP55822 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SH3BGRP55822 NUF2-202ENST00000367900 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SH3BGRP55822 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SH3BGRP55822 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SH3BGRP55822 OR5B12-201ENST00000302572 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
SH3BGRP55822 ANAPC10-201ENST00000309439 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SH3BGRP55822 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SH3BGRP55822 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SH3BGRP55822 RNU6-697P-201ENST00000363348 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SH3BGRP55822 MRRF-207ENST00000373729 870 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SH3BGRP55822 GAPDHP42-201ENST00000406848 981 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SH3BGRP55822 AL139039.2-201ENST00000407436 479 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SH3BGRP55822 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SH3BGRP55822 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SH3BGRP55822 ATG4AP1-201ENST00000416893 538 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SH3BGRP55822 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SH3BGRP55822 AC008154.2-201ENST00000420268 414 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SH3BGRP55822 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SH3BGRP55822 AL358876.1-201ENST00000453364 1075 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SH3BGRP55822 LDHBP2-201ENST00000456969 1005 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SH3BGRP55822 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SH3BGRP55822 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SH3BGRP55822 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SH3BGRP55822 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SH3BGRP55822 AC090673.1-204ENST00000504038 977 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SH3BGRP55822 AC109481.1-201ENST00000509173 282 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SH3BGRP55822 MAL2-207ENST00000522828 603 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SH3BGRP55822 GSTP1P1-201ENST00000548078 319 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SH3BGRP55822 AL355112.1-201ENST00000550309 1236 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SH3BGRP55822 LINC02327-205ENST00000550990 472 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SH3BGRP55822 AC026116.1-201ENST00000551729 474 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SH3BGRP55822 AL583810.3-201ENST00000555713 584 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
SH3BGRP55822 LINC00687-203ENST00000558175 696 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SH3BGRP55822 AGGF1P7-201ENST00000562369 913 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SH3BGRP55822 AC026620.1-201ENST00000584815 326 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SH3BGRP55822 AC010463.2-201ENST00000597592 661 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SH3BGRP55822 AC063977.5-201ENST00000601044 974 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SH3BGRP55822 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SH3BGRP55822 AP005431.1-201ENST00000618479 319 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SH3BGRP55822 AC127024.6-201ENST00000621598 424 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SH3BGRP55822 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SH3BGRP55822 AC007683.2-201ENST00000624681 714 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SH3BGRP55822 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SH3BGRP55822 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SH3BGRP55822 C5orf51-204ENST00000612065 1391 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SH3BGRP55822 CASC19-284ENST00000642142 1868 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SH3BGRP55822 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SH3BGRP55822 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SH3BGRP55822 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SH3BGRP55822 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SH3BGRP55822 POPDC3-201ENST00000254765 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SH3BGRP55822 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SH3BGRP55822 AC007382.1-201ENST00000624376 2618 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SH3BGRP55822 AL356317.1-201ENST00000396110 1436 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SH3BGRP55822 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SH3BGRP55822 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SH3BGRP55822 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SH3BGRP55822 GALNT13-202ENST00000409237 2591 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SH3BGRP55822 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SH3BGRP55822 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SH3BGRP55822 CDC16-202ENST00000252458 1991 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SH3BGRP55822 KCNRG-202ENST00000360473 1623 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SH3BGRP55822 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SH3BGRP55822 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SH3BGRP55822 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SH3BGRP55822 AL031985.1-201ENST00000392713 418 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SH3BGRP55822 KCNJ13-202ENST00000409779 1099 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SH3BGRP55822 RMRPP5-201ENST00000411156 267 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SH3BGRP55822 AL355300.1-201ENST00000412439 187 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SH3BGRP55822 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SH3BGRP55822 RPL12P28-201ENST00000430852 489 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SH3BGRP55822 RPS26P4-201ENST00000431743 355 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SH3BGRP55822 AC005297.1-201ENST00000444765 862 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SH3BGRP55822 AL450996.1-201ENST00000445574 1202 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SH3BGRP55822 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SH3BGRP55822 AL121877.1-201ENST00000453704 622 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SH3BGRP55822 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SH3BGRP55822 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SH3BGRP55822 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SH3BGRP55822 MYLK-AS2-202ENST00000515464 754 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SH3BGRP55822 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SH3BGRP55822 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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