Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 FOXP2-204ENST00000390668 1472 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 LAMTOR3-201ENST00000226522 1220 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 MLIP-203ENST00000370877 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 VDAC2P1-201ENST00000399358 958 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 AL121977.1-201ENST00000401636 979 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 AL356968.2-201ENST00000412769 1257 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 AL354868.1-201ENST00000417077 482 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 RPL36AP15-201ENST00000444514 266 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 SLC25A18P1-201ENST00000449385 454 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 TMEM246-AS1-204ENST00000450109 538 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 SLC9A9-AS2-201ENST00000490153 327 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 ETFRF1-211ENST00000557540 1259 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 AC109462.2-201ENST00000558730 763 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 AP000919.3-201ENST00000582591 568 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 AC015802.3-201ENST00000590241 570 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 FP236315.3-201ENST00000623587 307 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 TRIM51GP-201ENST00000534741 1350 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
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HOXD10P28358 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 VIP-202ENST00000367244 1584 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 TRAT1-202ENST00000426646 1596 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 PAK3-202ENST00000360648 2241 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 BMS1P3-201ENST00000372011 932 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
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HOXD10P28358 FGB-207ENST00000509493 1164 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 IGHVIII-76-1-201ENST00000523776 286 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 AP001542.3-201ENST00000587619 527 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 AC007193.1-201ENST00000599645 448 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 AL050403.2-203ENST00000603180 558 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 AL137072.1-201ENST00000603444 466 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 MILR1-203ENST00000615220 1196 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 AC079097.1-201ENST00000512187 1399 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
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