Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 GYPA-203ENST00000503627 318 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TRHP20396 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
TRHP20396 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
TRHP20396 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TRHP20396 AP002373.2-201ENST00000541631 1060 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
TRHP20396 AC103968.1-201ENST00000557841 573 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
TRHP20396 AP005209.1-201ENST00000582531 928 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TRHP20396 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TRHP20396 AC004908.1-201ENST00000606572 541 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
TRHP20396 RMST_5.1-201ENST00000618704 126 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
TRHP20396 LINC01822-201ENST00000435682 2098 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TRHP20396 PIWIL3-201ENST00000332271 3504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TRHP20396 HCG18-240ENST00000454269 2430 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TRHP20396 VIT-203ENST00000389975 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TRHP20396 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
TRHP20396 MLYCD-201ENST00000262430 13038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TRHP20396 STXBP5L-208ENST00000497029 3036 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TRHP20396 GRIP1-201ENST00000359742 5216 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TRHP20396 ARHGAP1-201ENST00000311956 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TRHP20396 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TRHP20396 LCA5-203ENST00000467898 2894 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TRHP20396 ZNF512-203ENST00000413371 3703 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TRHP20396 PTPDC1-204ENST00000620992 4437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TRHP20396 EPS8-207ENST00000540613 2204 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TRHP20396 KIF23-207ENST00000559279 3411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TRHP20396 ITSN2-213ENST00000622089 5805 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TRHP20396 AC009053.1-202ENST00000563377 2051 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
TRHP20396 DCTN4-203ENST00000447998 4208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TRHP20396 SLC22A24-203ENST00000612278 2101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TRHP20396 AC011379.1-201ENST00000508713 3025 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
TRHP20396 ZKSCAN5-201ENST00000326775 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TRHP20396 SH3D19-203ENST00000409598 5284 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TRHP20396 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TRHP20396 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
TRHP20396 AC117402.1-202ENST00000383686 820 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TRHP20396 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
TRHP20396 SRI-202ENST00000394641 653 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TRHP20396 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
TRHP20396 AL590609.2-201ENST00000421430 368 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
TRHP20396 SKP1P3-201ENST00000429280 487 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
TRHP20396 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TRHP20396 AC005008.1-201ENST00000456151 612 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
TRHP20396 RN7SL515P-201ENST00000463999 297 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
TRHP20396 AC010307.1-201ENST00000467206 836 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
TRHP20396 RN7SL390P-201ENST00000470634 284 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
TRHP20396 RN7SL332P-201ENST00000482163 254 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
TRHP20396 NDUFS5P2-201ENST00000484004 306 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
TRHP20396 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
TRHP20396 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TRHP20396 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
TRHP20396 ATP6V0E1-202ENST00000517669 502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TRHP20396 IGLC4-201ENST00000517690 248 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
TRHP20396 IGKV2-19-201ENST00000518132 283 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
TRHP20396 AC012400.1-201ENST00000518452 381 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
TRHP20396 AC083923.2-203ENST00000520512 372 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TRHP20396 KCTD21-AS1-206ENST00000532831 856 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TRHP20396 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TRHP20396 AC010325.1-202ENST00000562076 279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TRHP20396 AP005119.1-201ENST00000580956 292 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
TRHP20396 AC069061.3-201ENST00000582254 823 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
TRHP20396 ZNF418-210ENST00000600989 597 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TRHP20396 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
TRHP20396 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
TRHP20396 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TRHP20396 SETBP1-201ENST00000282030 9899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TRHP20396 MUSK-205ENST00000374448 2754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TRHP20396 ABRAXAS2-201ENST00000298492 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TRHP20396 FBXO7-202ENST00000397426 1888 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TRHP20396 TBX5-202ENST00000349716 3585 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TRHP20396 AMBN-202ENST00000449493 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TRHP20396 GPX6-204ENST00000612264 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TRHP20396 CAPRIN1-209ENST00000530820 3454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TRHP20396 MAPK10-260ENST00000641047 2546 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
TRHP20396 ZNF155-209ENST00000611002 2732 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TRHP20396 U91328.2-201ENST00000606723 4130 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TRHP20396 OSBPL3-203ENST00000396431 2969 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TRHP20396 NPIPB5-205ENST00000424340 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TRHP20396 HLTF-208ENST00000494055 3633 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TRHP20396 UBE2N-205ENST00000550657 3018 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TRHP20396 KCNJ15-207ENST00000398934 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TRHP20396 KIAA1217-207ENST00000396445 5706 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TRHP20396 CCDC15-203ENST00000529051 3924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TRHP20396 ZKSCAN8-202ENST00000457389 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TRHP20396 EXOC6-204ENST00000443748 3310 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TRHP20396 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TRHP20396 ALPK1-205ENST00000504176 5203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TRHP20396 HELQ-201ENST00000295488 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TRHP20396 AP2B1-221ENST00000621914 5702 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TRHP20396 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
TRHP20396 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TRHP20396 KIF2C-201ENST00000372217 2955 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TRHP20396 PPP3R1-203ENST00000409752 851 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TRHP20396 METTL15P3-201ENST00000415522 1221 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
TRHP20396 ARHGAP42P2-201ENST00000416089 2140 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
TRHP20396 AC062016.2-201ENST00000420950 676 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
TRHP20396 AL080316.1-201ENST00000432438 499 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TRHP20396 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TRHP20396 AC138207.1-201ENST00000442757 545 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TRHP20396 AL512649.2-201ENST00000446206 597 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TRHP20396 OR1H1P-201ENST00000448731 937 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms