Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 AL162430.2-201ENST00000422306 435 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 OR5W1P-201ENST00000423705 938 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 RPL7AP14-201ENST00000424041 802 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 RPS7P14-201ENST00000426405 583 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 IGLV3-4-201ENST00000432300 244 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 AC006947.1-201ENST00000457168 484 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 RPL5P24-201ENST00000463742 885 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 PSAT1P4-201ENST00000466500 526 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 STMN1P2-201ENST00000508435 439 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 ATG10-208ENST00000513634 618 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 AC010342.1-201ENST00000514047 877 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 RNU6-1308P-201ENST00000516817 103 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 AC104036.1-201ENST00000523550 611 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 TRIM77BP-201ENST00000524985 1119 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 AC073941.1-201ENST00000559148 539 ntTSL 4 BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 AC092332.1-201ENST00000563684 829 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 MRPS21P8-201ENST00000569196 235 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 AP005209.1-201ENST00000582531 928 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 AC008507.3-201ENST00000585753 472 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 AC027243.2-201ENST00000602530 724 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 AC016747.2-201ENST00000605902 364 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 AC004921.1-201ENST00000608884 733 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 MRPL57P1-201ENST00000621486 265 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 NPHP1-203ENST00000393272 2752 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 ATP1B4-203ENST00000539306 4644 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 PCDH15-231ENST00000617271 6425 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 LYARP1-201ENST00000436977 1501 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 SERPINB11-205ENST00000544088 1846 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 AC027575.3-201ENST00000583058 2747 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 Z83820.1-201ENST00000456978 1499 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 DDX58-202ENST00000379883 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 AC092821.2-201ENST00000545710 2042 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 SLC10A7-202ENST00000394059 1730 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 HYDIN-215ENST00000541601 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 PGK2-201ENST00000304801 1657 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 MAGEB16-203ENST00000399988 1682 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 SYTL5-202ENST00000456733 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 KCNJ10-207ENST00000638868 3883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 MLLT3-203ENST00000380338 6772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 CCT6B-203ENST00000436961 1639 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 CHRM3-AS2-201ENST00000427859 2431 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 NCOA4P3-201ENST00000513203 1877 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 KCNH7-205ENST00000621889 1893 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 ZSCAN12-202ENST00000396827 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 KCNN3-205ENST00000618040 13057 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 TRIM6-TRIM34-201ENST00000354852 3391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 SOD2-211ENST00000538183 14266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 ERLIN2-211ENST00000523887 2347 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 UTP6-201ENST00000261708 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 GAS1RR-201ENST00000415801 4387 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 LINC02275-201ENST00000508313 4365 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 AC008033.1-201ENST00000216407 1162 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 HIST1H1T-201ENST00000338379 718 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 POU1F1-201ENST00000344265 1149 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 S100A5-201ENST00000368717 506 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 LCN1P2-201ENST00000372030 223 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 AC005323.2-201ENST00000399342 583 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 RN7SKP121-201ENST00000410842 305 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 AL162408.1-201ENST00000428853 433 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 RPS29P14-201ENST00000431518 171 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 LINC01350-201ENST00000436955 642 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 UBE2V1P3-201ENST00000439651 417 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 TRIM60P16-201ENST00000444048 694 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 ARL5AP2-201ENST00000444698 533 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 AC114814.1-201ENST00000444926 691 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 LINC01825-201ENST00000452381 850 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 AC098824.1-201ENST00000453565 980 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 PPIAP27-201ENST00000453800 265 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 PPIAP7-201ENST00000454070 489 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 UBTFL6-201ENST00000477929 1024 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 RN7SL714P-201ENST00000487050 298 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 MTND6P8-201ENST00000503471 522 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 AC010343.3-202ENST00000510327 619 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
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