Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 LINC02319-201ENST00000555852 349 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 AC090518.1-202ENST00000568246 578 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 RPL12P25-202ENST00000598100 674 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 AC005191.1-201ENST00000603950 358 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 AL359757.1-201ENST00000623176 255 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC6.02□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 MYO5A-209ENST00000553916 5989 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 AL356317.1-201ENST00000396110 1436 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 OR51B3P-201ENST00000412287 913 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 GLUD1P9-201ENST00000420997 1173 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 AL136231.1-201ENST00000429407 730 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 AL136455.1-201ENST00000441083 1240 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 LINC00366-201ENST00000441430 435 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 ARL2BPP10-201ENST00000446487 531 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 EEF1A1P25-201ENST00000495704 1267 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 LINC02201-203ENST00000514657 674 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 AC087783.1-201ENST00000527135 564 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 AP003306.1-201ENST00000529875 353 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 AC048338.2-201ENST00000623601 684 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 TRIM51GP-201ENST00000534741 1350 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 AC011447.7-201ENST00000624228 1590 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 FPGT-208ENST00000534056 1426 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 NAV3-201ENST00000397909 9821 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 OR1L4-201ENST00000259466 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 CARD16-201ENST00000375704 613 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 LINC01198-201ENST00000416521 500 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 AL592293.2-201ENST00000422292 996 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 AP002981.1-201ENST00000517692 975 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 ALOX12P2-208ENST00000574183 519 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 MIR4433B-201ENST00000581329 102 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 AL445423.1-201ENST00000609941 536 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 AC016717.3-201ENST00000624730 554 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 OR52N4-202ENST00000641350 1276 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 NPM1P38-201ENST00000403835 865 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 LINC01047-201ENST00000415193 778 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 AC023141.6-201ENST00000429418 337 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 TAS2R39-201ENST00000446620 1017 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 AP001596.1-202ENST00000452460 644 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 CR383656.1-201ENST00000484916 377 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 AC025674.1-201ENST00000507074 324 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 RNU6ATAC39P-201ENST00000516309 149 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 ANP32E-205ENST00000533654 908 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 AC024224.2-201ENST00000544225 782 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 182.2 ms