Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 OR4A2P-201ENST00000527276 913 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 PCED1B-AS1-203ENST00000547626 420 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 MTND4LP24-201ENST00000572277 291 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 AC069366.1-201ENST00000583159 838 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 ZNF230-204ENST00000585632 579 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 ZNF283-207ENST00000593164 1260 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 OR2BH1P-201ENST00000608850 864 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 MIR325HG-208ENST00000630388 1043 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 LINC01359-206ENST00000634775 888 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 ATM-229ENST00000639953 587 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 AL354696.2-201ENST00000619407 1910 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 FAM26D-202ENST00000368597 1311 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 AL365214.2-201ENST00000433684 1365 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 SNX18P3-202ENST00000565670 1750 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 DCN-204ENST00000425043 1438 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 ZC3H7A-214ENST00000575984 2632 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 FAM205A-201ENST00000378788 4225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 UGT2B11-201ENST00000446444 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 SNW1-204ENST00000554775 1687 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 REP15-201ENST00000310791 1078 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 SPINK9-201ENST00000377906 453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 CFHR3-203ENST00000391985 1043 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 AL034403.1-201ENST00000399414 885 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 RPL31-206ENST00000409650 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 BX284632.2-201ENST00000421091 399 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 DPYD-IT1-201ENST00000424982 401 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 AL353608.2-201ENST00000425587 340 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 Z84478.1-201ENST00000438230 1219 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 MTCYBP12-201ENST00000440559 1134 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 AL512605.1-202ENST00000441919 381 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 AL359955.2-201ENST00000445380 353 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 AL645937.3-201ENST00000453647 936 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 AC104831.1-201ENST00000470024 444 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 PLGLA-202ENST00000482249 475 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 RPS26P24-201ENST00000497656 331 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 PRB1-202ENST00000500254 775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 AC106895.1-202ENST00000502956 777 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 PGRMC2-203ENST00000503588 818 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 AC105924.1-201ENST00000504057 339 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 BX510359.5-201ENST00000515651 304 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 OR5AM1P-201ENST00000532136 1032 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 OR10G5P-201ENST00000532733 358 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 LDHC-203ENST00000535809 757 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 LDHC-205ENST00000537486 583 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 AC023906.4-201ENST00000557898 895 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 GARSP1-201ENST00000570895 719 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 AC022211.1-201ENST00000579554 717 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 AC100844.1-201ENST00000580622 440 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 AC099811.4-201ENST00000592536 496 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
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USP18Q9UMW8 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 AL358072.1-201ENST00000604156 575 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 MIR6809-201ENST00000612189 116 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 AC243829.4-201ENST00000620056 701 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 AL390318.1-201ENST00000624564 687 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 DARS-AS1-227ENST00000627442 633 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 LGI1-209ENST00000627699 664 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 AC092111.2-201ENST00000611627 1414 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 MSANTD2-204ENST00000526629 3086 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 IFI16-202ENST00000340979 2732 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 ORC3-202ENST00000392844 2512 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 AP000547.3-204ENST00000588548 2523 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
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