Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 AC007922.3-201ENST00000581648 543 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AC015802.3-201ENST00000590241 570 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 OR7E18P-201ENST00000592589 702 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 TAS2R6P-201ENST00000605022 826 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 RPL23AP61-201ENST00000623642 466 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 SMARCA2-231ENST00000634931 939 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 ECT2L-203ENST00000423192 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 AC006210.2-201ENST00000367074 1545 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 AC012361.1-201ENST00000447260 1498 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 LINC01317-201ENST00000366209 779 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 AC005522.1-201ENST00000395416 346 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 NPM1P10-201ENST00000398310 865 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 BTF3P9-201ENST00000418784 283 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 RPA2P2-201ENST00000419698 796 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 AL357315.1-201ENST00000422930 254 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 MORF4L2-205ENST00000423833 717 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 AL359853.3-201ENST00000423879 544 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 RNF19BPX-201ENST00000426224 625 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 AC007556.1-201ENST00000432133 307 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 AL606490.7-201ENST00000433136 191 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 AC005772.1-201ENST00000446671 976 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 AL589703.1-201ENST00000456032 256 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 APOPT1-204ENST00000473127 739 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 RN7SL799P-201ENST00000475891 298 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 SETSIP-201ENST00000485873 879 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 AC010395.1-201ENST00000507627 697 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 ATG10-208ENST00000513634 618 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 AC026719.2-201ENST00000515656 295 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 AC090753.1-201ENST00000522087 331 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 AC114550.3-201ENST00000524073 579 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 AC113418.1-201ENST00000569928 517 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 PSMG2-204ENST00000585331 983 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 AC010320.2-203ENST00000601745 574 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 AP004372.1-201ENST00000604842 844 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 AC092902.2-219ENST00000608488 822 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 FSHB-202ENST00000417547 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 TTC39DP-201ENST00000416781 1688 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 NUP37-201ENST00000251074 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 ELOC-201ENST00000284811 683 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 TEX36-201ENST00000368821 922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 AL136116.2-201ENST00000404020 785 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 LINC00342-201ENST00000412393 654 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 LINC01740-201ENST00000423842 332 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 HNRNPA1P29-201ENST00000426409 879 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 MAGI2-AS3-204ENST00000426835 738 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 TRIM60P13-201ENST00000432350 1283 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 AL450992.2-201ENST00000434182 506 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 AL139002.1-201ENST00000435281 902 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 SCAND3P1-201ENST00000439854 1060 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 AL139121.1-201ENST00000445647 244 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 NPM1P39-201ENST00000449818 867 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 C2orf80-207ENST00000453017 722 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.9 ms