Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 AL136501.1-201ENST00000555913 790 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 RNASE9-208ENST00000556208 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 RNASE9-210ENST00000557209 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 AC023394.1-201ENST00000578673 312 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 AC008507.2-201ENST00000588402 1176 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 AL157392.3-211ENST00000599378 509 ntTSL 4 BASIC7.68□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 AL158050.2-201ENST00000605336 568 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 IQCH-214ENST00000629425 1822 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 GABPB1-204ENST00000396464 1401 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 LMNTD1-202ENST00000413632 1520 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 C4orf17-201ENST00000326581 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 LDAH-212ENST00000619656 3663 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 AC234772.1-201ENST00000377927 937 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 RNU6-207P-201ENST00000384137 107 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 FABP12P1-201ENST00000401911 322 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 RSL24D1P1-201ENST00000404972 493 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 PTCD2P2-201ENST00000415579 1095 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 HYALP1-201ENST00000417674 1279 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 AC021035.1-201ENST00000421597 427 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 AC005033.1-201ENST00000428904 813 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 AL663074.2-201ENST00000440621 479 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 CEACAMP7-201ENST00000444105 496 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 BX119904.2-201ENST00000446495 512 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 RAB28P2-201ENST00000454299 641 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 RPL7P45-201ENST00000455851 743 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 ST13P12-201ENST00000508958 1094 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 LINC02147-201ENST00000509367 807 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 RPS3A-210ENST00000512690 845 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 AC084706.1-201ENST00000521879 558 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 AL158801.3-201ENST00000555514 363 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 AC016134.1-201ENST00000565259 701 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 OR2L13-202ENST00000641714 1948 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 RGS1-201ENST00000367459 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 MOB1B-201ENST00000309395 6963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 OR5K4-201ENST00000354924 966 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 RN7SKP166-201ENST00000410812 305 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 AC009784.1-201ENST00000426484 460 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 DEFB130D-201ENST00000426866 237 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 EIF4EBP2P1-201ENST00000450009 343 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 RPL7P48-201ENST00000461513 746 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 CEP70-205ENST00000464035 1054 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 DAP3-209ENST00000465375 729 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 RN7SL97P-201ENST00000486780 299 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 AC078814.2-201ENST00000552996 535 ntTSL 4 BASIC7.66□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 AC025917.1-201ENST00000562062 612 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 AC003682.1-201ENST00000599190 462 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 AC104785.1-201ENST00000603220 588 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 AC124016.2-201ENST00000610058 665 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 AL671511.2-201ENST00000611838 659 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 AL163952.1-201ENST00000612704 916 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 AL356118.1-201ENST00000635272 1078 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 AC063952.1-204ENST00000635496 927 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 SUPT3H-206ENST00000637763 498 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
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