Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 ANXA1-201ENST00000257497 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 CABS1-201ENST00000273936 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 AL590763.1-201ENST00000398297 1545 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 ASXL1-203ENST00000375689 812 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 PSMA3-202ENST00000412908 908 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 VN1R37P-201ENST00000419096 748 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 RPS26P4-201ENST00000431743 355 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 RPL34P6-201ENST00000432390 345 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 HSFY7P-201ENST00000432672 318 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 NMNAT1P2-201ENST00000435192 860 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 AL590762.3-201ENST00000436372 640 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 HSFY8P-201ENST00000437934 318 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 AC021180.1-201ENST00000508581 558 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 LINC01088-208ENST00000511895 795 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 HDAC2-AS2-207ENST00000518470 563 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 AC090022.1-201ENST00000546569 311 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 PSMA4-209ENST00000559082 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 MIR762HG-201ENST00000564901 648 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 AC015802.3-201ENST00000590241 570 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 OR8G7P-201ENST00000616658 848 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 UBE2NL-201ENST00000618570 1185 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 SYNJ2BP-COX16-205ENST00000621525 929 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 AC015871.5-202ENST00000623252 701 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 AC002384.2-201ENST00000636036 790 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 AL031656.1-202ENST00000457704 1995 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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TM6SF1Q9BZW5 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 BDH2-201ENST00000296424 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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TM6SF1Q9BZW5 ARV1-202ENST00000366658 1170 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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TM6SF1Q9BZW5 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
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TM6SF1Q9BZW5 LINC01798-203ENST00000428590 553 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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TM6SF1Q9BZW5 AP001434.1-201ENST00000444977 287 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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TM6SF1Q9BZW5 CREM-220ENST00000463314 964 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 TOPORSLP1-201ENST00000467693 2102 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 RPS18P6-201ENST00000476880 458 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 AC117394.1-201ENST00000477323 567 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 FXN-205ENST00000498653 856 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 TIFA-202ENST00000500655 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 AC145141.1-201ENST00000510180 567 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 AP001961.1-201ENST00000515782 526 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 AC006511.5-202ENST00000546339 1198 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 AC023906.4-201ENST00000557898 895 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 AL353811.1-202ENST00000602614 618 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 AL139407.1-201ENST00000613826 1175 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 AC022106.2-201ENST00000620114 757 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 AL139254.3-201ENST00000641097 674 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
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