Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AL355306.2-209ENST00000437803 357 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 PCBP1-AS1-232ENST00000442040 1111 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 LINC01307-202ENST00000444327 771 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AL009048.1-201ENST00000450437 298 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 LINC01312-202ENST00000456347 813 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 RN7SL205P-201ENST00000490174 284 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 FO393419.2-201ENST00000492975 428 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 RN7SL808P-201ENST00000496066 299 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 TMED11P-203ENST00000502630 533 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AC147055.3-201ENST00000510547 851 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AC093248.1-201ENST00000513197 417 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 NPM1P21-201ENST00000513394 762 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 C8orf22-203ENST00000517663 788 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AP006245.2-201ENST00000522004 300 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AP003066.2-201ENST00000529375 555 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 NPM1P35-201ENST00000533043 868 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AC066613.1-201ENST00000559977 1053 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AC025271.2-201ENST00000566990 800 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AC233266.2-201ENST00000567067 528 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 RBM22P1-201ENST00000578589 1214 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AC145207.6-201ENST00000579981 782 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AC008543.4-201ENST00000585694 442 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 MIMT1-201ENST00000597105 1050 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AL445222.1-201ENST00000607259 628 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 CYCSP41-201ENST00000616920 296 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 CCL4-203ENST00000621626 552 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AP002505.2-201ENST00000623585 696 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AC004160.1-201ENST00000625468 929 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AL590396.4-201ENST00000636779 956 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 DNAJC12-202ENST00000339758 1064 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 KIF16B-202ENST00000355755 606 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
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ZNF548Q8NEK5 AC003975.1-201ENST00000411856 837 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AC098592.2-201ENST00000413158 265 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 SMIM2-IT1-201ENST00000415082 478 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 ICA1L-206ENST00000418208 602 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AL359878.2-201ENST00000435531 407 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AL359265.1-201ENST00000440296 795 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AC069277.2-201ENST00000454211 432 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 RN7SL423P-201ENST00000486202 304 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
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ZNF548Q8NEK5 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 LINC02480-201ENST00000511875 612 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 ZBED3-AS1-209ENST00000512213 681 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 RNU5A-7P-201ENST00000515979 116 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AC025300.1-201ENST00000526616 384 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
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ZNF548Q8NEK5 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
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ZNF548Q8NEK5 AC104009.1-203ENST00000531304 571 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 KCTD21-AS1-206ENST00000532831 856 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AC005000.1-201ENST00000536192 288 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AC024224.2-201ENST00000544225 782 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 PPFIA2-AS1-202ENST00000549161 1080 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AC090666.1-201ENST00000578241 445 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 APOC2-203ENST00000590360 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 MTCO2P2-201ENST00000591258 225 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AL050403.2-203ENST00000603180 558 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AL645927.2-201ENST00000618350 349 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 GXYLT1P5-202ENST00000618830 589 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AC079298.2-201ENST00000623885 459 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
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