Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 AC079097.1-201ENST00000512187 1399 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 LINC02097-201ENST00000419257 2063 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 OR11H6-201ENST00000315519 993 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 AL158050.1-201ENST00000416077 457 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 HSPE1P16-201ENST00000426640 348 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 LINC01967-202ENST00000437506 515 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 RPL12P3-201ENST00000440080 396 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 AC073850.1-201ENST00000449243 255 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 TMEM247-203ENST00000449601 741 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 RPL7P55-201ENST00000450522 746 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 OTX2P1-201ENST00000450956 354 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 HMGB1P5-202ENST00000451497 985 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 LINC01767-201ENST00000451914 545 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 CLIC4P1-201ENST00000453177 535 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 CBX1P5-201ENST00000475330 559 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 AC020779.1-201ENST00000478757 796 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 EIF4E-204ENST00000504432 1132 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 AC103853.1-201ENST00000520588 649 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 HIGD1AP18-201ENST00000520730 278 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 ARL6IP1P3-201ENST00000524544 560 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 AP003386.1-201ENST00000526509 504 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 EIF4A2P5-201ENST00000529914 499 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 AC068768.1-204ENST00000544890 796 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 AC087897.2-201ENST00000552639 678 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 GPATCH2L-203ENST00000553588 776 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 AC009396.1-201ENST00000553628 1079 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 AC008543.4-201ENST00000585694 442 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 AC133794.1-201ENST00000602731 914 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 AC025175.1-201ENST00000606482 759 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 DUXB-201ENST00000633875 1079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 UPRT-207ENST00000530743 1636 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 LPAR4-205ENST00000614823 2155 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 TNFAIP8-207ENST00000513374 1385 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 RABGAP1L-206ENST00000367688 1425 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 RPE65-201ENST00000262340 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 AC007382.1-201ENST00000624376 2618 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 TMPRSS15-201ENST00000284885 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 GLYAT-201ENST00000278400 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 RNU6-252P-201ENST00000363232 107 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 MRRF-207ENST00000373729 870 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 U3.28-201ENST00000391249 210 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 CHMP1B2P-201ENST00000399581 597 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 STAT4-203ENST00000409995 709 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 RNU2-17P-201ENST00000410290 190 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 RPL23AP18-201ENST00000416139 468 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 VN1R42P-201ENST00000424651 344 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 Z82246.1-201ENST00000428201 457 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 AL121957.1-202ENST00000437040 329 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 RPS23P9-201ENST00000448848 438 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 AL035409.1-201ENST00000454305 497 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 AC107398.1-201ENST00000486904 505 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 AC027627.1-201ENST00000506895 753 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 LINC02039-201ENST00000507428 566 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 GTF2F2P1-201ENST00000511083 675 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 AC108120.2-201ENST00000512973 294 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 EIF3KP3-201ENST00000514461 639 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 MS4A6A-210ENST00000529054 1160 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 AC009237.13-201ENST00000603193 276 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 AC112503.2-201ENST00000609005 552 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 AC015712.7-201ENST00000615211 635 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
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