Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
FSCN1Q16658 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
FSCN1Q16658 MTND5P23-201ENST00000430812 1655 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
FSCN1Q16658 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
FSCN1Q16658 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
FSCN1Q16658 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
FSCN1Q16658 NXF3-201ENST00000395065 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
FSCN1Q16658 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
FSCN1Q16658 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
FSCN1Q16658 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
FSCN1Q16658 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
FSCN1Q16658 MTND4P8-201ENST00000514997 1362 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
FSCN1Q16658 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
FSCN1Q16658 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
FSCN1Q16658 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
FSCN1Q16658 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
FSCN1Q16658 DDX18P6-201ENST00000450119 1997 ntBASIC6.27□□□□□ -1.4
FSCN1Q16658 OR2L13-202ENST00000641714 1948 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
FSCN1Q16658 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
FSCN1Q16658 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
FSCN1Q16658 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
FSCN1Q16658 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
FSCN1Q16658 RN7SKP6-201ENST00000364795 319 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
FSCN1Q16658 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
FSCN1Q16658 AL360271.1-201ENST00000395679 510 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
FSCN1Q16658 AL121977.1-201ENST00000401636 979 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
FSCN1Q16658 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
FSCN1Q16658 RN7SKP125-201ENST00000410481 302 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
FSCN1Q16658 AC092638.1-201ENST00000411966 1275 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
FSCN1Q16658 Z82246.1-201ENST00000428201 457 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
FSCN1Q16658 AL049749.1-201ENST00000430281 632 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
FSCN1Q16658 HSFY3P-201ENST00000444242 1191 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
FSCN1Q16658 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
FSCN1Q16658 RPL7P32-201ENST00000457119 744 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
FSCN1Q16658 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
FSCN1Q16658 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
FSCN1Q16658 AC084871.1-201ENST00000508020 628 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
FSCN1Q16658 AC093297.1-201ENST00000511712 591 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
FSCN1Q16658 AC013644.1-201ENST00000523724 555 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
FSCN1Q16658 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
FSCN1Q16658 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
FSCN1Q16658 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
FSCN1Q16658 AP000857.2-201ENST00000532123 419 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
FSCN1Q16658 KCTD21-AS1-206ENST00000532831 856 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
FSCN1Q16658 LINC02294-201ENST00000549330 497 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
FSCN1Q16658 AC016134.1-201ENST00000565259 701 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
FSCN1Q16658 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
FSCN1Q16658 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
FSCN1Q16658 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
FSCN1Q16658 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
FSCN1Q16658 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
FSCN1Q16658 AC010435.1-201ENST00000623353 1177 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
FSCN1Q16658 AC112694.2-201ENST00000623697 768 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
FSCN1Q16658 AP002967.1-201ENST00000624203 539 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
FSCN1Q16658 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
FSCN1Q16658 TLR10-208ENST00000622002 3673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
FSCN1Q16658 AC005225.5-201ENST00000623547 2225 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
FSCN1Q16658 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
FSCN1Q16658 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
FSCN1Q16658 LIPF-203ENST00000394375 1470 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
FSCN1Q16658 AP002478.1-201ENST00000577848 1455 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
FSCN1Q16658 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
FSCN1Q16658 GABRA1-218ENST00000637827 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
FSCN1Q16658 FCGR3B-208ENST00000613418 2251 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
FSCN1Q16658 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
FSCN1Q16658 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
FSCN1Q16658 AHNAK2-201ENST00000333244 18254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
FSCN1Q16658 LINC01222-201ENST00000427439 1785 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
FSCN1Q16658 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
FSCN1Q16658 MGC32805-205ENST00000510972 1424 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
FSCN1Q16658 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
FSCN1Q16658 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
FSCN1Q16658 LMNTD1-202ENST00000413632 1520 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
FSCN1Q16658 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
FSCN1Q16658 ABCB11-201ENST00000263817 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
FSCN1Q16658 ORC3-202ENST00000392844 2512 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
FSCN1Q16658 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
FSCN1Q16658 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
FSCN1Q16658 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
FSCN1Q16658 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
FSCN1Q16658 GPR52-201ENST00000367685 1088 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
FSCN1Q16658 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
FSCN1Q16658 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
FSCN1Q16658 MIR585-201ENST00000384887 94 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
FSCN1Q16658 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
FSCN1Q16658 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
FSCN1Q16658 RNU6-316P-201ENST00000391027 107 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
FSCN1Q16658 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
FSCN1Q16658 ATP5F1P2-201ENST00000398143 760 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
FSCN1Q16658 RNU4-22P-201ENST00000411058 166 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
FSCN1Q16658 AL590806.1-201ENST00000415818 853 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
FSCN1Q16658 AL645465.1-201ENST00000417765 642 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
FSCN1Q16658 LINC00400-201ENST00000425609 547 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
FSCN1Q16658 FO393419.3-201ENST00000428741 282 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
FSCN1Q16658 AC005033.1-201ENST00000428904 813 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
FSCN1Q16658 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
FSCN1Q16658 AL645937.3-201ENST00000453647 936 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
FSCN1Q16658 AC239798.3-201ENST00000454459 408 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
FSCN1Q16658 VN1R40P-201ENST00000455196 941 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
FSCN1Q16658 OSTCP1-201ENST00000455507 450 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89 ms