Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 CASC19-206ENST00000641028 1430 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 FHL5-201ENST00000326771 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 AC068446.1-201ENST00000556425 1549 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 LDHC-201ENST00000280704 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 NPM1-202ENST00000351986 1237 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 SNORA58B-201ENST00000364259 136 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 AMELX-202ENST00000380712 835 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 AMELX-203ENST00000380714 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 KRTAP3-2-201ENST00000391587 702 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 NUDT19P3-201ENST00000404698 555 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 AL390036.1-201ENST00000419428 734 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 RC3H1-IT1-201ENST00000421851 448 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 CNOT7P2-201ENST00000441051 832 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 AC009487.1-201ENST00000444164 403 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 RPS26P41-201ENST00000450370 284 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 AL589703.1-201ENST00000456032 256 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 AC020779.1-201ENST00000478757 796 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 AC079841.1-201ENST00000481228 950 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 OR11I1P-201ENST00000486033 954 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 SUMO2P4-201ENST00000504193 276 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 AC106732.1-201ENST00000512458 550 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 AC090572.2-201ENST00000520649 761 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 AC022832.1-201ENST00000530718 645 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 AP001970.1-201ENST00000531681 701 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 MRE11-209ENST00000540013 1212 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 AC011595.3-201ENST00000546699 632 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 AC023906.4-201ENST00000557898 895 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 AC015660.2-201ENST00000561362 323 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 MIR762HG-201ENST00000564901 648 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 AC142086.4-201ENST00000568904 650 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 AL353600.1-201ENST00000608148 251 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 AL359513.1-201ENST00000614364 557 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 OR10X1-201ENST00000623167 981 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 AC135068.12-201ENST00000637370 931 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 UGT2B26P-201ENST00000508672 1613 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 AL513548.1-201ENST00000562904 1724 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 PMCHL1-201ENST00000418902 1917 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 AC109780.1-201ENST00000451768 1344 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 SYT14P1-202ENST00000600441 1448 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 AC007394.1-201ENST00000421941 531 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 AC006455.6-201ENST00000426192 893 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 FAM96AP1-201ENST00000430879 482 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 AC009948.1-206ENST00000436616 1020 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 PTMAP6-201ENST00000439110 327 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 IMMP2L-205ENST00000450877 761 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 AL645937.3-201ENST00000453647 936 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 AC087664.1-201ENST00000521456 358 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 AC079089.1-204ENST00000530194 572 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 LINC01489-201ENST00000542689 605 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 G2E3-AS1-201ENST00000548631 579 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 AC144548.2-201ENST00000550231 946 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 AC116553.2-201ENST00000564203 463 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 AC234775.3-201ENST00000564612 656 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 AC015845.2-201ENST00000581805 472 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 BNIP3P32-201ENST00000600015 554 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 AC022960.2-201ENST00000616300 666 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 RFC1-217ENST00000639695 867 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 AC073869.7-201ENST00000640874 297 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 MIPEPP2-201ENST00000422560 1819 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 268.2 ms