Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 AL078612.2-201ENST00000525133 646 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
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SS18Q15532 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
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SS18Q15532 AC020743.2-201ENST00000639870 1370 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SS18Q15532 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
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