Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 AC073358.1-201ENST00000505671 684 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 AC027627.1-201ENST00000506895 753 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 AC020661.4-201ENST00000561388 500 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 AL162574.1-201ENST00000615702 950 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 LINC00976-202ENST00000628064 534 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 ATMIN-204ENST00000564241 4803 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 MMAA-205ENST00000541599 1437 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 MOCS2-203ENST00000450852 1337 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 AP003080.1-202ENST00000526526 915 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 CCDC178-208ENST00000579916 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 LINC01676-204ENST00000595309 871 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 PIGN-217ENST00000591238 1622 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 PHF7-211ENST00000615126 1328 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 AC017048.1-201ENST00000412153 495 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 FAM237A-201ENST00000441223 773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 AC096759.1-201ENST00000510744 473 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 AC011468.1-201ENST00000569091 675 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 DIAPH2-AS1-204ENST00000579945 974 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 UBA2-208ENST00000592791 910 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 Z98949.1-220ENST00000609809 804 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 INTS6-AS1-226ENST00000610018 672 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 AC087633.2-201ENST00000618611 725 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 PRDM2-202ENST00000311066 7437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 PSAT1P4-201ENST00000466500 526 ntBASIC6.21□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 AC090589.1-201ENST00000473109 362 ntBASIC6.21□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 EIF4E-204ENST00000504432 1132 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 LINC02502-201ENST00000505122 642 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 AP005119.2-201ENST00000579735 1105 ntBASIC6.21□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 ZNF836-203ENST00000597065 808 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 IGKV1OR2-9-201ENST00000603957 287 ntBASIC6.21□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 IGKV1OR2-11-201ENST00000604120 287 ntBASIC6.21□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC6.21□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC6.21□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 GVINP1-201ENST00000526769 8438 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 ANKRD44-201ENST00000282272 5147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 VNN3-203ENST00000392393 1603 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 AC025428.2-201ENST00000435367 2672 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 AC012358.3-203ENST00000366287 1110 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 AC092159.1-201ENST00000433724 493 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 AC128716.1-201ENST00000475129 166 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 AC112206.2-204ENST00000504068 793 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
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