Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 AL138733.1-201ENST00000415477 853 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 AK4P4-201ENST00000419465 646 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 AC006007.1-201ENST00000422084 672 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 OSTCP5-201ENST00000425293 453 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 AL035246.1-201ENST00000433554 1255 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 TPTE2P3-201ENST00000441562 1189 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 MTND2P8-201ENST00000450555 1025 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 RPS26P39-201ENST00000469206 341 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 DWORF-201ENST00000489090 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 AP003028.1-203ENST00000525832 444 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 HMGN2P36-201ENST00000529541 409 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 AC012170.3-201ENST00000560159 297 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 AC007225.2-201ENST00000562529 256 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 AC009145.2-201ENST00000562685 377 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 AC007431.2-201ENST00000577189 563 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 AC119403.2-201ENST00000590960 598 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 AC090621.1-201ENST00000592121 419 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 TTN-AS1-245ENST00000592182 749 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 LINC01050-201ENST00000604485 760 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 MILR1-203ENST00000615220 1196 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 AC011472.4-201ENST00000615848 491 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 AC008115.4-201ENST00000619780 775 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 AC087565.3-203ENST00000641018 837 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 OR6C71P-202ENST00000641886 1107 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 AL355306.2-206ENST00000635233 1903 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 FBXL21-201ENST00000297158 1305 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 PHF7-211ENST00000615126 1328 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 VN2R3P-201ENST00000422626 1412 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 C17orf78-203ENST00000611038 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 AC007618.1-201ENST00000366455 732 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 OR51B3P-201ENST00000412287 913 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 OR2AT2P-201ENST00000413438 905 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 SLC4A1APP1-201ENST00000419995 602 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 NANOGP5-201ENST00000424456 877 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 MKLN1-204ENST00000429546 572 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 KRTAP8-2P-201ENST00000440620 186 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 HSFY3P-201ENST00000444242 1191 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 MTND1P33-201ENST00000446251 917 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 RPL7P45-201ENST00000455851 743 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 CREM-220ENST00000463314 964 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 AC107015.1-201ENST00000466902 747 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 GCSAM-204ENST00000484193 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 CEP170-216ENST00000490813 1070 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 LINC02234-202ENST00000513288 705 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 ZFAND1-208ENST00000519523 698 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 MOCS2-208ENST00000527216 707 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 AC016987.1-201ENST00000558587 499 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 AC084757.2-201ENST00000559165 540 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 AC100821.2-201ENST00000565668 440 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 AC090617.5-201ENST00000571815 528 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 AC009121.2-202ENST00000572706 505 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 SS18L2P2-201ENST00000583960 235 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 AC006504.5-212ENST00000587188 746 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 AC022031.2-203ENST00000587346 565 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 AC145207.9-201ENST00000623802 325 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 ADAMTS9-AS1-210ENST00000625328 699 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 AC092375.1-202ENST00000639452 404 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 OR4F17-202ENST00000585993 2669 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 LINC01192-202ENST00000470546 1519 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms