Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 TPTE2P1-203ENST00000434100 514 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 AL138787.1-202ENST00000437804 898 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 OR7E125P-201ENST00000443450 846 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 AL137845.2-201ENST00000444292 988 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 SUMO2P1-206ENST00000445436 284 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 GAPDHP14-201ENST00000450472 937 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 MTND2P3-201ENST00000452458 470 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 HIGD1AP8-201ENST00000453927 274 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 C1DP3-201ENST00000455013 423 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 DUBR-205ENST00000495228 411 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 AC095056.1-201ENST00000503918 425 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 ATG10-AS1-201ENST00000504846 648 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 AC087272.1-201ENST00000523624 533 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 AC087636.1-201ENST00000554787 573 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 AC016987.1-201ENST00000558587 499 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 DISC1FP1-202ENST00000562245 774 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 UBA2-208ENST00000592791 910 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 AC010894.2-203ENST00000606406 499 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 AL354696.1-201ENST00000614652 497 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 ZNRD1ASP-221ENST00000637794 1074 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 MTND5P23-201ENST00000430812 1655 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 RBMS1-203ENST00000409075 1550 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 RNASE6-201ENST00000304677 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 OR10AG1-201ENST00000312345 1016 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 AL589826.1-201ENST00000340697 249 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 PIGP-204ENST00000399102 688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 MIR937-201ENST00000401271 86 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 AL021331.1-201ENST00000402817 582 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 AL136116.2-201ENST00000404020 785 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 LINC01442-201ENST00000414201 704 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 AL035604.1-201ENST00000416481 531 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 AL590762.4-201ENST00000425885 253 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 OR10J4-201ENST00000504970 935 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
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CDH18Q13634 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
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CDH18Q13634 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 LINS1-207ENST00000560133 1196 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 AC007014.1-201ENST00000572828 610 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
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CDH18Q13634 AC093330.1-201ENST00000583326 568 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 AC005324.5-201ENST00000584540 571 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 EIF1P5-201ENST00000585002 234 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 AC104365.3-201ENST00000587011 625 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 AC006116.4-201ENST00000589671 452 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
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CDH18Q13634 AC022387.2-201ENST00000604050 448 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 MEMO1P5-201ENST00000604810 406 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 AC008833.1-201ENST00000611633 691 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 Mico1.1-201ENST00000611698 204 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 OSER1-AS1-205ENST00000623343 827 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 AC112694.2-201ENST00000623697 768 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
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